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lianyi1989

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】求助3'-RACE问题

做的3'-RACE出条带了,回收了之后,转化测序,测序结果找不到上游引物,只能找到下游引物UPM,还以为转化有问题。再次连接,转化,测序结果依然如此,还是找不到上游引物,真不知道什么原因,请各位高手指教下,多谢啦~
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whoisthis

铁虫 (小有名气)


lianyi1989(金币+1):谢谢参与
测序结果能和你之前得到的片段拼接上吗?如果能的话找不到也无所谓啦。
2楼2010-09-11 05:15:32
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lianyi1989

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by whoisthis at 2010-09-11 05:15:32:
测序结果能和你之前得到的片段拼接上吗?如果能的话找不到也无所谓啦。

拼接不上呀,要是拼接上的话我就不在这发愁了...测序结果跟目的片段一点都拼接不上
3楼2010-09-11 09:58:47
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sdqzsdqz

木虫 (著名写手)


lianyi1989(金币+1):谢谢参与
我觉得还是处在连接这步了,再看看序列
4楼2010-09-11 10:39:30
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lianyi1989

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by sdqzsdqz at 2010-09-11 10:39:30:
我觉得还是处在连接这步了,再看看序列

连接会出现什么问题呢?我感觉做的时候没什么差错啊
5楼2010-09-11 11:02:45
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小猫三两只

金虫 (正式写手)


lianyi1989(金币+1):谢谢参与
3-RACE还是比较容易做的,严格按照说明书上的来做
6楼2010-09-11 11:15:29
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whoisthis

铁虫 (小有名气)

结果比对之后是你要的这个基因吗
是的话再设计引物p片段和3‘之间那段

不是的话重新设计GSP
7楼2010-09-11 14:12:10
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yujiaping1

木虫 (著名写手)


lianyi1989(金币+1):谢谢参与
楼主所谓的3RACE出带,和目标片段的大小完全一致吗?
8楼2010-09-11 15:13:37
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jasco

木虫 (正式写手)


lianyi1989(金币+1):谢谢参与
可能是单引物延伸产物,而不是真的3'race产物
9楼2010-09-11 15:54:49
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lianyi1989

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by jasco at 2010-09-11 15:54:49:
可能是单引物延伸产物,而不是真的3'race产物

出的条带与目标片段大小事一致的~如果是你说的单引物延伸扩展,是不是要重新设计引物?
10楼2010-09-12 11:28:12
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