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xinyaolu

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】连接总是连不上,如何解决 已有10人参与

本人最近在将一段2500bp的片段连到8100bp的质粒上。片段先连到克隆载体上,但一直无法连到8100bp的质粒上。期间尝试了不同的摩尔比例,连接液使用Takare的solution I,16℃连接过夜,也尝试了电转,但很多情况下连假阳性都没有。已经做了3周了,还请高手们出招指教。非常感谢!
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怎么都行

银虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
1949stone(金币+3):够细致 2010-08-28 13:06:28
LZ是把片段先连接到克隆载体上然后再切下来连到目的质粒上么?可能原因有下:
1  酶切回收的片段是你的目的片段么?
2  你的质粒和你的片段是用同样的内切酶切的么?(保证他们有相同的粘末端)
3  如果是单酶切,那你的质粒最好在连接片段前做去磷酸化处理,防止它在连接反应中自身环化。
4  尝试换一下连接体系,比如改用NEB的T4连接体系。
5  你的质粒不适宜在该种感受态细胞中扩增。
我能想到的原因就这些,实在不行,你要把整个过程重新来过,或许在构建的前期阶段某个失误导致后来的实验失败。
2楼2010-08-28 12:01:24
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j2

木虫 (正式写手)

你这么知道是没连上捏?
修炼ing,当虫仙……
3楼2010-08-28 12:58:44
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duckcat

银虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
直接用takara的T4连接酶不好吗,连接6个小时足矣!连不上就邪门了
4楼2010-08-28 15:34:21
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danny0426

新虫 (初入文坛)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
silicare(金币+1):这个贼重要! 2010-08-28 23:18:50
有没有排除感受态的问题?
5楼2010-08-28 21:59:45
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微笑漩涡

新虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
倘若实在做不出来,可以考虑先连接T载体,然后酶切下来连现在的这个载体。
6楼2010-08-28 23:12:20
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linysm

银虫 (小有名气)

大片段连接确实不好连,看看有没有相关适合你用的试剂盒。加大目的片段的比例。
7楼2010-08-29 10:46:43
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zhangrq_hu

木虫 (著名写手)

路过,学习学习
8楼2010-08-29 11:03:06
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xinyaolu

木虫 (小有名气)

感谢大家的回复,这个质粒已经连上。
由于前面做的连接一直比较顺,从没有考虑过DNA浓度的问题。所以在不断的失败后,提高了载体和片段的浓度,载体150ng,片段和载体比例为10:1,载体和片段混合后65℃保温5分钟,随后冰上放置1分钟,加入solution I ,连接过夜,转化JM109。菌落PCR挑光了两块板子70个转化子,阳性的有3个。构建这个质粒前后一共挑了将近1000个转化子,终于连上。
9楼2010-09-05 22:08:31
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hou88com

金虫 (小有名气)

为人低调


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
在其他条件都认为正确的前提下,查看你的酶切位点,如果是双酶切的话最好不是相邻的两个酶切位点。
Timelysnowfortellsabumperharvest.
10楼2010-09-06 19:42:34
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