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芥末蚕豆

铜虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
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帖子: 49
在线: 17.9小时
虫号: 959015
注册: 2010-03-01
性别: MM
专业: 微生物学

[交流] 【求助/交流】16s 构建进化树已有7人参与

弱弱的请问：我想构建16s RNA进化树，我在NCBI上检索16s 的基因序列，但好多都是rimM、sun或是其他的一些16S ribosomal RNA 上的一些基因，不是16S ribosomal RNA gene，所以我想知道我到底要下载哪种基因构建进化树啊？好多菌种检索不到16S ribosomal RNA gene 啊！

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开心就好！

1楼2010-08-25 19:32:43

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lwh66

金虫 (小有名气)

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注册: 2009-07-24
专业: 微生物生理与生物化学

我一直是用BLAST，网上分析下，得到结果后，按相似度进行选择性下载，这样快点，不过确实不是所有的菌都有很多16S ribosomal RNA gene 。

6楼2010-08-30 09:45:05

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