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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】我的菌如何确定究竟是什么菌？
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yusuya

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】我的菌如何确定究竟是什么菌？ 已有5人参与

我的一株放线菌，经16SrDNA测序后构建进化树，结果我的菌与三个菌的相似度均为100%，我该如何进一步确定我的菌究竟是什么菌呢？
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1楼 2011-01-05 16:25:28
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

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Originally posted by yusuya at 2011-01-05 16:25:28:
我的一株放线菌，经16SrDNA测序后构建进化树，结果我的菌与三个菌的相似度均为100%，我该如何进一步确定我的菌究竟是什么菌呢？

16SrDNA是初步鉴定，如要准确鉴定的话需要做生理生化实验。
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The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
2楼2011-01-05 16:30:59
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yusuya

木虫 (小有名气)
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Originally posted by brightfuture01 at 2011-01-05 16:30:59:



16SrDNA是初步鉴定，如要准确鉴定的话需要做生理生化实验。

我查了那三个菌的生理生化特征，对于同一种菌，同一种指标，说的都不一样，那我该怎么确定啊？
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3楼2011-01-05 16:33:27
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brightfuture01

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Originally posted by yusuya at 2011-01-05 16:33:27:

我查了那三个菌的生理生化特征，对于同一种菌，同一种指标，说的都不一样，那我该怎么确定啊？

还有这种事情，查查伯杰氏手册。还有看哪个跟文献相关，具体看看文献。
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4楼2011-01-05 16:36:07
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yusuya

木虫 (小有名气)
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Originally posted by brightfuture01 at 2011-01-05 16:36:07:



还有这种事情，查查伯杰氏手册。还有看哪个跟文献相关，具体看看文献。

有时候就算已经鉴定某个菌是什么菌了，但是那么多生理生化指标，有些也会有些差异的，所以直接用生理生化特征来鉴定似乎也不太可靠吧？还有没有别的办法呢？
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5楼2011-01-05 16:42:36
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brightfuture01

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看天(金币+1):鼓励 2011-01-05 17:39:58
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Originally posted by yusuya at 2011-01-05 16:42:36:

有时候就算已经鉴定某个菌是什么菌了，但是那么多生理生化指标，有些也会有些差异的，所以直接用生理生化特征来鉴定似乎也不太可靠吧？还有没有别的办法呢？

IJSEM上的那些指标，16S，生理生化，G+C 也就这些了吧，莫非你要全基因组测序
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6楼2011-01-05 16:53:45
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rainwander

铁杆木虫 (知名作家)

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Originally posted by brightfuture01 at 2011-01-05 16:53:45:



IJSEM上的那些指标，16S，生理生化，G+C 也就这些了吧，莫非你要全基因组测序

如果不差钱的话，就测吧，哈哈
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千万不要因为走的太久，而忘记了我们为什么出发~~~~~~ForDream~~~~~~
7楼2011-01-05 17:53:50
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zhaoyilu

禁虫 (小有名气)
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8楼2011-01-05 19:00:39
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qingshi2

银虫 (小有名气)
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你到底是为了做什么呢 和那三株100%相似的是一种菌的三个种吧
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9楼2011-01-05 20:17:47
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yusuya

木虫 (小有名气)
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Originally posted by qingshi2 at 2011-01-05 20:17:47:
你到底是为了做什么呢 和那三株100%相似的是一种菌的三个种吧

链霉菌的三个不同的种，我要确定我的菌到底是哪各种，不知道该如何确定。
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10楼2011-01-06 09:43:50
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