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yusuya

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】我的菌如何确定究竟是什么菌? 已有5人参与

我的一株放线菌,经16SrDNA测序后构建进化树,结果我的菌与三个菌的相似度均为100%,我该如何进一步确定我的菌究竟是什么菌呢?
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
看天(金币+1):鼓励 2011-01-05 17:39:58
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Originally posted by yusuya at 2011-01-05 16:42:36:

有时候就算已经鉴定某个菌是什么菌了,但是那么多生理生化指标,有些也会有些差异的,所以直接用生理生化特征来鉴定似乎也不太可靠吧?还有没有别的办法呢?

IJSEM上的那些指标,16S,生理生化,G+C 也就这些了吧,莫非你要全基因组测序
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
6楼2011-01-05 16:53:45
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brightfuture01

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看天(金币+1):鼓励 2011-01-05 17:39:37
引用回帖:
Originally posted by yusuya at 2011-01-05 16:25:28:
我的一株放线菌,经16SrDNA测序后构建进化树,结果我的菌与三个菌的相似度均为100%,我该如何进一步确定我的菌究竟是什么菌呢?

16SrDNA是初步鉴定,如要准确鉴定的话需要做生理生化实验。
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2楼2011-01-05 16:30:59
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yusuya

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by brightfuture01 at 2011-01-05 16:30:59:



16SrDNA是初步鉴定,如要准确鉴定的话需要做生理生化实验。

我查了那三个菌的生理生化特征,对于同一种菌,同一种指标,说的都不一样,那我该怎么确定啊?
3楼2011-01-05 16:33:27
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brightfuture01

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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by yusuya at 2011-01-05 16:33:27:

我查了那三个菌的生理生化特征,对于同一种菌,同一种指标,说的都不一样,那我该怎么确定啊?

还有这种事情,查查伯杰氏手册。还有看哪个跟文献相关,具体看看文献。
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
4楼2011-01-05 16:36:07
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