| 查看: 2106 | 回复: 9 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
wdali金虫 (正式写手)
|
[交流]
【求助】求一个磷脂双分子膜的PDB文件 已有3人参与
|
||
| 小弟听闻脂质双分子层是可以构造出来的，所以想看看各位哥哥姐姐们手头有没有现成的，不不胜感激啊。 |
回复此楼» 猜你喜欢
论文终于录用啦！满足毕业条件了
已经有4人回复
-
2025年遐想
已经有4人回复
-
投稿Elsevier的杂志（返修），总是在选择OA和subscription界面被踢皮球
已经有8人回复
-
自然科学基金委宣布启动申请书“瘦身提质”行动
已经有4人回复
-
求个博导看看
已经有18人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 求助，已有PDB结构的DS同源建模步骤，谢谢
已经有11人回复
- 如何做动力学模拟pdb文件
已经有4人回复
- 把一个pdb的蛋白质复合物 保存成prmtop 和inpcrd 文件
已经有3人回复
- 如何从下载的PDB文件中提取酶的活性中心
已经有6人回复
- 如何制作简单的化学分子的pdb文件
已经有11人回复
- gmx不认小分子PDB残基怎么办？？
已经有4人回复
- 磷脂双分子层模型怎么建立？
已经有4人回复
- pdb文件中加入氢原子
已经有7人回复
- AutoDock产生的结果dlg文件转化成pdb文件
已经有13人回复
- 【求助】构建水-磷脂膜-水环境模型
已经有9人回复
- 【求助】如何合并文件 pdb psf
已经有4人回复
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
如果你问的是脂双层（就是三明治那种）的的话，只用GROMACS就可以， 这是官网教程http://cgmartini.nl/index.php/tutorials-general-introduction/bilayers 这是中文版的http://jerkwin.github.io/2016/11/03/Martini实例教程Lip/ 里面的这个文件bilayer_tutorial.zip里面有所需要的模拟用文件，和已经模拟后的结果文件（可用来自己模拟后比较用），其中结构就是pdb格式的，再加上轨迹文件可用VMD查看到双层形成过程 如果你问的是脂质体那种球状的话，可以用packmol或者charmm-gui(跑的时候有水洞，最后封上)， 资料或文献也可在网上查到， 不过他是先摆成球的样子，再跑一跑的，查看的话用VMD就行， 数据分析在教程里也都有，具体各个数据分析什么意思可查找知网的中文文献，里面有中文的，比较好理解。 |
10楼2017-03-15 22:52:53