24小时热门版块排行榜    

查看: 1267  |  回复: 4

hnndpt

铁虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】仍然是关于引物的一个问题!!! 已有2人参与

欲克隆棉花中的一个基因,在NCBI上已经搜索到这个基因mRNA的全长,目的是要编码区,以后可能转基因药用,请问该怎样设计引物?
       有同学说直接从起始密码子开始设计,也有人说从起始密码子前的一段序列中设计。我也想从起始密码子开始设计,于是选用编码区前21个碱基作为引物,但是用软件分析后发现这个引物不太合适,存在错配,颈环等现象,利用引物设计软件设计发现在起始密码子附近没有合适的引物,请问我该怎么办?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

love_st

金虫 (著名写手)


软件给出的分析结果毕竟也只是参考,很多时候条件不好,扩增或许也还不错的
2楼2010-08-10 11:33:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ben1147

木虫 (正式写手)

★ ★
amisking(金币+2):good! 2010-08-10 12:52:27
lmzxcom1:其实更多时候还是要认为去设计和验证的,不要依赖软件,它只是辅助 2010-08-10 13:06:40
hnndpt(金币+1): 2010-08-10 15:12:29
5'UTR长度是有限的,要想扩全长只能在这里设计了
软件只是个理论情况,选几个还看得过去的引物,实际P一下看看,调整一下条件,用用Touchdown,加点DMSO之类的,没准能P出来呢
一旦有了条带赶紧克隆到质粒上,测序正确的话以后就直接从质粒上切或者P
3楼2010-08-10 12:15:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shenfei-

铜虫 (小有名气)

其实软件处理的结果只是理论,稍微优化下,找几对引物P一下看看,一般可以的
走别人的路,只能让自己无路可走;走自己的路,让别人跟着走
4楼2010-08-10 15:29:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mgangle

铁杆木虫 (著名写手)

乐乐家族-----乐颠颠

hnndpt(金币+1): 2010-08-11 09:00:14
软件分析只供参考,因为你要扩全长就必须在这个位置扩增,所以你可以在扩增时通过调整退火温度来到达目的!
麦兜麦兜~~~我要一碗鱼丸粗面。。对不起,么有鱼丸粗面。。那,我要鱼丸么有鱼丸那,我要粗面…………么有粗面那,我要鱼丸粗面……………………
5楼2010-08-10 15:57:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 hnndpt 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 5/250 2026-08-30 14:03 by GkCVyODlx4mR
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +6 德尚中行 2026-08-27 7/350 2026-08-30 12:53 by Bxndjjd
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +3 雨打竹帘 2026-08-30 4/200 2026-08-30 12:35 by 白大多亮
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 8/400 2026-08-30 12:03 by l0VvVHGBGRLv
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-30 11:52 by l0VvVHGBGRLv
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-30 11:41 by l0VvVHGBGRLv
[博后之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +8 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-30 11:40 by l0VvVHGBGRLv
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-30 11:19 by l0VvVHGBGRLv
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-30 11:18 by l0VvVHGBGRLv
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +6 gdd2018 2026-08-28 11/550 2026-08-30 08:58 by 超级无敌华子
[考博] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 4/200 2026-08-30 01:34 by ZPa0EcMwuECS
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
信息提示
请填处理意见