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hunter3401

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】如何构建系统更发育树 已有12人参与

本人做了一株菌的16S,现在想构建它系统发育树,请虫友们帮忙看下,这样做是否合理,首先Clustx进行多序列比对,将比对的结果MEGA分析——N-Jtree.如果合理的话该如何选择用来进行比对的菌的序列?假如说我的菌与枯草芽孢杆菌有99%的相似性,那么我是在这些结果里来找序列进行Clustx比对吗?
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reasonspare

木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
silicare(金币+1):谢谢参与~ 2010-08-25 12:37:47
w我看了一下该网站:应该说还是不错,因为如果你稍微懂点perl,你就能到ncbi 夏在所有的16S 甚至专门下载模式菌株的 16S, 所以说对于初学者,或者不求甚解(不求甚解在这里解释为:如果连试验菌株所在属的其他模式菌株都不知道,你还知道什么?那你进行菌株鉴定的意义又是什么,哈哈,开个玩笑)的人,完全可以通过这个网站进行分析。
大慈大悲观世音救苦救难观世音有求必应观世音普渡众生观世音千手千眼观世音官大敢管观世音无处不在观世音普观普长观世音南无观世音菩萨
11楼2010-08-25 10:22:06
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