24小时热门版块排行榜    

查看: 2997  |  回复: 8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

wjlouc

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】autodock 如何对含金属化合物的分子做对接 已有2人参与

本人在用autodock 对含金属化合物的分子做对接时, 生成GPF时报错。请教大家是否要对金属做特殊处理?或者是autodock无法做含金属化合物的分子做对接?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

君子生非异也,善假于物也!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

x-cool

金虫 (小有名气)


wjlouc(金币+1): 谢谢参与
我也想做金属离子的对接 ,用sybyl8.0做。希望各位高手指点。
x-cool
5楼2012-05-21 18:05:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

wjmed

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
wjlouc(金币+1):谢谢参与
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-07-29 09:50:48
分子包含哪种金属?
autodoc可以计算的金属原子类型有:
Mg   Non H-bonding Magnesium
MG   Non H-bonding Magnesium
Ca   Non H-bonding Calcium
CA   Non H-bonding Calcium
Mn   Non H-bonding Manganese
MN   Non H-bonding Manganese
Fe   Non H-bonding Iron
FE   Non H-bonding Iron
Zn   Non H-bonding Zinc
ZN   Non H-bonding Zinc

[ Last edited by wjmed on 2010-7-29 at 05:53 ]
Timeandtidewaitsfornoman!
2楼2010-07-29 05:49:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tjegg

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
wjlouc(金币+1):谢谢参与
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-07-29 09:50:54
我私下认为,和金属的对接,基本上是不准的。
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
3楼2010-07-29 07:43:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小丁0912

金虫 (正式写手)


wjlouc(金币+1):谢谢参与
楼主遇到和我一样的问题,我也想做金属配合物的分子对接
4楼2010-09-05 14:49:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 5/250 2026-08-23 04:07 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 4/200 2026-08-23 04:04 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 7/350 2026-08-23 03:43 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 6/300 2026-08-23 03:40 by OEbVnUOu01ol
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 9/450 2026-08-23 03:31 by OEbVnUOu01ol
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 3/150 2026-08-23 00:55 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[基金申请] 人气不行了 +8 fansofjerry 2026-08-21 8/400 2026-08-22 16:30 by zyqchem
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 14/700 2026-08-21 23:51 by cratir
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +10 kulium 2026-08-21 13/650 2026-08-21 21:58 by alongwaytogo
[基金申请] 让我中一个面上吧! +11 大萍1987 2026-08-20 13/650 2026-08-21 14:48 by 20120902066
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
请填处理意见