【求助】NAMD和Gromacs哪个简单？ - 分子模拟 - Gromacs/Amber/NAMD

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匿名

用户注销 (正式写手)

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1楼2010-07-18 22:37:14

已阅同方向广播申请模拟EPI 回复此楼编辑删除查看我的主页

superdirac

木虫 (正式写手)

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★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+4):谢谢 2010-08-01 14:48:08

只能是实际情况了。
  namd的强大。
  1。在于可以使用tcl脚本去自己编写一些程序。就是可以根据你自己的情况去改些东西。
2。并且最近出来的colvar用来算自由能也是很强大的一个工具。
3。最近出来的namd都是可以用cuda加速的，速度会快很多。

  gmx也很强大。有很多计算技术，例如CGMD，REMD现在都是在gmx上实现的。不过要是自己修改的话，就不如namd那么方便了。

赞一下(2人)

回复此楼

我认为，酒一口一口喝，路一步一步走~步子迈大了，喀~容易扯着蛋

4楼2010-08-01 14:42:33

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