| 查看: 6624 | 回复: 19 | |||||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||||||
[交流]
【求助成功】怎么样提高NEB计算速度?
|
|||||||
|
怎么样设置才能提高计算速度?原来算image=1,五天了还没有收敛.今天开始image=3,不知道要几天.算过的给点指导意见. 呵呵,硬件条件受限制 55个原子的slab INCAR: ENCUT = 480 !经过优化的最小数值,文献最高取500 NPAR = 2 NELMIN = 5 EDIFF = 1E-4 EDIFFG = -0.05 LREAL = Auto NSW = 60 GGA = 91 POTIM = 0.3 !经过多次测试计算,感觉比较合理 IMAGES = 3 SPRING = -5 ! NEB 方法 IBRION = 1 ISMEAR =0 VOSKOWN =1 PREC = Accurate 硬件:单机E5410两颗,8核,8G内存. OS red hat enterprise linux 5.2 Kpoints: Auto 0 M-K 2 2 1 0 0 0 内存使用率90%, 六核并行 [ Last edited by cenwanglai on 2010-6-14 at 09:50 ] |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 第一性原理和电化学 | VASP计算资料收集byZF | 模拟，理论 | vasp计算总结 |
» 猜你喜欢
依托企业入选了国家启明计划青年人才。有无高校可以引进的。
已经有14人回复
-
江汉大学解明教授课题组招博士研究生/博士后
已经有3人回复
-
AI 太可怕了，写基金时，提出想法，直接生成的文字比自己想得深远，还有科学性
已经有11人回复
-
依托企业入选了国家启明计划青年人才。有无高校可以引进的。
已经有11人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 新手请教用NEB方法计算energy barrier.
已经有15人回复
- 关于NEB计算的基本问题
已经有7人回复
- vasp NEB 如何选取原胞大小 ？
已经有10人回复
- 【求助】请教CNEB
已经有15人回复
- 【求助】关于CI-NEB
已经有21人回复
- 【文献学习】JACS上一篇纯DFT计算的文献： CI-NEB计算，Leuwdin布局分析，态密度分析
已经有30人回复
- 【求助】NEB算过渡态出现致命错误
已经有5人回复
- 【其他】vasp neb 计算讨论
已经有20人回复
- 【讨论】NEB寻找过渡态专题讨论
已经有49人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
医学超声影像负责人招聘-中国科学院赣江创新研究院
+1/974
-
西湖大学2026年秋季入学物理学、光学、电子信息方向博士生有名额速来！！！
+2/224
-
西湖大学拓扑光学、非厄米光学、太赫兹方向博士后招聘
+2/224
-
苏州国家实验室和中国科学技术大学联培博士招生
+1/179
-
上海交通大学大气环境科学课题组招收2026年入学博士生
+1/66
-
同济大学脑机智能团队脑机接口方向招生招聘
+1/29
-
湖南大学-分析检测技术和生物柔性传感器-招收1名博士研究生 (2026年，第二批)
+1/16
-
香港中文大学（深圳）陈筱萌 课题组招生公告（博士 / 博后 / 硕士 / RA）
+1/14
-
墨尔本大学(QS13)招全奖博士、CSC资助博士/访问学者(生物医学材料/器官芯片等方向)
+1/10
-
中科院深圳先进技术研究院招聘免疫及计算生物学方向博士后、科研助理或联培学生
+1/9
-
怎么发布了求助贴了， 一发就转到删除栏了
+1/8
-
澳门大学生物医学影像实验室诚招博士生（2026秋季入学）
+1/7
-
宁波诺丁汉大学招收26年秋/27年春固废协同转化与低碳冶金方向全奖博士生
+1/7
-
华南师范大学（211）- 光电科学与工程学院 - 申请审核制（2026年4-5月份面试考核）
+2/6
-
电子科技大学李世彬课题组招聘传感器方向博士及博士后
+1/6
-
【科研助理招聘-北京理工大学-集成电路与电子学院-国家杰青团队】
+1/5
-
香港中文大学（深圳）陈筱萌 课题组招生公告（博士 / 博后 / 硕士 / RA）
+1/4
-
26储能博士申请自荐
+1/1
-
斯德哥尔摩 DigitalFuture 博士后奖学金机会！
+1/1
-
大连海事大学船舶洁净能源研究中心2026年博士研究生招生启事
+1/1
7楼2010-06-13 17:10:31
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+2):谢谢指导 2010-06-13 07:57:21
cenwanglai(金币+3):呵呵,希望再看看下面一条. 2010-06-13 09:53:44
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+2):谢谢指导 2010-06-13 07:57:21
cenwanglai(金币+3):呵呵,希望再看看下面一条. 2010-06-13 09:53:44
|
个人感觉你的INCAR不太适合做NEB 根据vtstcode的说明 我觉得这个INCAR比较合理 收敛也会比较快 主要 的区别是用了global lbfgs method（IOPT=1）去优化反应路径 如果觉得自己的初始guess比较好的话 可以将invcurv提高到0.05 或者先用0.01做几步 然后用新的初始路径提交并将invcurv提高到0.05 其他的没什么了 就是把一些默认值写出来 感觉更清楚一点 另外优化一般vasp计算速度的参数也尽量加 比如LPLANE=.TRUE. ;NSIM=4 试试看 ENCUT = 480 !经过优化的最小数值,文献最高取500 NPAR = 2 LPLANE=.TRUE.;NSIM=4 NELMIN = 5 EDIFF = 1E-4 EDIFFG = -0.05 LREAL = Auto NSW = 60 GGA = 91 IBRION=3 POTIM = 0.0 !经过多次测试计算,感觉比较合理 ICHAIN=0 IMAGES = 3 SPRING = -5 ! NEB 方法 LCLIMB=.TRUE. IOPT=1 #global lbfgs method LGLOBAL=.TRUE. MAXMOVE=0.2 # max step INVCURV=0.01 # initial curvature ISMEAR =0 VOSKOWN =1 PREC = Accurate  |
2楼2010-06-13 00:05:08
|
谢谢你的回复,呵呵. 我用的是NEB,不是CNEB. 有四个小疑问: (1) IBRION =3 要比IBRION =1快一些? 我感觉,较快的迭代方法每(离子)步的时间要短一些,但总的迭代部数可能要多一些.没有实证,观察了几个算例,可能不具有普遍性. (2)NEB与CNEB相比,可能找到的能量最高点并不是真正的能量最高点.但是如果只关心能垒的话,NEB是不是也够呢?比如IMAGES=3的话,中间点的能量可能就已经非常接近过度态了.但从构型上看,CNEB与NEB差别是不是较大呢?比如过度态的键长和角度? (3)POTIM=0.0?是笔误还是有意?这样设置的物理意义是什么? (4)怎么减少image?如果用CNEB只算一个image怎么样? 手册上说用坚持用最少的image.那么,第一次在00与02之间只用一个imageA,第二次在00与imageA之间再插入一个imageB,第三次在imageA与02之间插如一个imageC;这样计算的结果与image=3,一次在00与02之间插入imageB,imageA ,imageC是不是等效的? [ Last edited by cenwanglai on 2010-6-13 at 09:50 ] |
3楼2010-06-13 09:47:39
cenwanglai(金币+8):呵呵,4*2.意思意思.欢迎常来第一性原理. 2010-06-13 10:45:27
cenwanglai(金币+2):这个是斑竹身份,呵呵,不是自己的省着点花. 2010-06-13 10:47:35
cenwanglai(金币+2):这个是斑竹身份,呵呵,不是自己的省着点花. 2010-06-13 10:47:35
|
1. IBRION=3 + POTIM=0.0 实际上是把vasp自带的优化算法关掉 实际使用的是IOPT=1 这些参数的意义需要看http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/optimizers/ 2. 实际上用CI-NEB要比普通的NEB收敛性好一些 而且计算的能垒更准确 过渡态的构型更准 3. 见1 4. 只要路径收敛就应该是等效的 还是建议你用CI-NEB 我觉得比较好的办法是先用一个image 算CI-NEB 收敛之后在过渡态的两边各插一个或者两个点 一共3个或5个image 再进行一次计算 可以得到反应路径的粗略信息 关键是还可以观察在两个local minimal 之间是不是还有中间的local minimal. 如果有的话最好把路径分开成两个计算 |
4楼2010-06-13 10:27:10