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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】氨基酸序列比对
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jiaqifang

铁杆木虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】氨基酸序列比对 已有5人参与

请问现在我有一个氨基酸序列，该怎么样去蛋白质数据库中比对？
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1楼 2010-06-12 21:02:38
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liyong1981

金虫 (正式写手)
这方面的数据库比较多，~记
不清了~
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6楼2010-06-13 16:51:01
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mazhenning

新虫 (初入文坛)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
scelab(金币+1):鼓励新虫！欢迎多来交流！:tiger06: 2010-06-12 22:55:47
可以到NCBI网站，使用Blast软件比对
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-06-12 22:11:44
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jiaqifang

铁杆木虫 (小有名气)
谢谢 那我要知道这个蛋白的功能、性质及结构模型呢？
赞一下 回复此楼
3楼2010-06-12 23:03:00
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月月大可

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
在PDB中比对可以获得蛋白质的三维结构，如果该结构已经发表文章，也会对应有文章的链接。
具体比对方法：
1、 PDB数据库主业  http://www.pdb.org/pdb/home/home.do
2、点击右上角的 Advanced search
3、在choose a query Type选择 quences(Blast/fasta)
4、黏贴你的AA序列，提交。就可以获得比对结果。

三维模型通过安装插件后可以直接在线看。
赞一下(4人) 回复此楼
4楼2010-06-12 23:40:50
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