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jiaqifang

铁杆木虫 (小有名气)

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[交流] 【求助/交流】氨基酸序列比对已有5人参与

请问现在我有一个氨基酸序列，该怎么样去蛋白质数据库中比对？

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1楼 2010-06-12 21:02:38

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月月大可

木虫 (著名写手)

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★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流

在PDB中比对可以获得蛋白质的三维结构，如果该结构已经发表文章，也会对应有文章的链接。
具体比对方法：
1、 PDB数据库主业 http://www.pdb.org/pdb/home/home.do
2、点击右上角的 Advanced search
3、在choose a query Type选择 quences(Blast/fasta)
4、黏贴你的AA序列，提交。就可以获得比对结果。

三维模型通过安装插件后可以直接在线看。

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