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jiaqifang

铁杆木虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】氨基酸序列比对 已有5人参与

请问现在我有一个氨基酸序列,该怎么样去蛋白质数据库中比对?
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mazhenning

新虫 (初入文坛)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
scelab(金币+1):鼓励新虫!欢迎多来交流!:tiger06: 2010-06-12 22:55:47
可以到NCBI网站,使用Blast软件比对
2楼2010-06-12 22:11:44
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jiaqifang

铁杆木虫 (小有名气)

谢谢 那我要知道这个蛋白的功能、性质及结构模型呢?
3楼2010-06-12 23:03:00
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月月大可

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
在PDB中比对可以获得蛋白质的三维结构,如果该结构已经发表文章,也会对应有文章的链接。
具体比对方法:
1、 PDB数据库主业  http://www.pdb.org/pdb/home/home.do
2、点击右上角的 Advanced search
3、在choose a query Type选择 quences(Blast/fasta)
4、黏贴你的AA序列,提交。就可以获得比对结果。

三维模型通过安装插件后可以直接在线看。
4楼2010-06-12 23:40:50
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jiaqifang

铁杆木虫 (小有名气)

谢谢!我去试试
5楼2010-06-13 12:23:24
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liyong1981

金虫 (正式写手)


这方面的数据库比较多,~记
不清了~
6楼2010-06-13 16:51:01
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jiaqifang

铁杆木虫 (小有名气)

帮忙回忆一下啊 谢谢
7楼2010-06-13 21:08:14
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zcqcau

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ExPASY这个网站,全是关于蛋白预测的
将有能量帮助他人作为自己的人生追求!
8楼2010-06-14 00:28:00
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