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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 动植物 » 综合其他 » 【求助/交流】系统进化发育树
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JAuu

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】系统进化发育树 已有9人参与

请教：用基因序列的方法做物种的系统进化发育树，一般用什么序列？
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1楼 2010-06-05 20:35:15
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cofe

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
用蛋白序列
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2楼2010-06-05 21:33:44
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ben1147

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
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1949stone(金币+2):谢谢交流 有道理 2010-06-05 22:13:52
如果是做特定基因的聚类分析，用不同物种这一基因或基因家族中各个成员翻译得到的蛋白质氨基酸序列做

如果没有特定的基因，而是做物种的亲缘，就用不同物种间在进化上比较保守的蛋白（比如CytC）的氨基酸序列做
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3楼2010-06-05 22:11:53
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scien55

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
请问有什么软件做进化树呢？？
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好好学习天天向上
4楼2010-06-05 23:35:38
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ben1147

木虫 (正式写手)
★
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引用回帖:
Originally posted by scien55 at 2010-06-05 23:35:38:
请问有什么软件做进化树呢？？

clustalW比对对齐之后用MEGA 4.0建树
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5楼2010-06-05 23:37:12
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JAuu

银虫 (小有名气)
能不能推荐一些经典文献呢？3Q~
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6楼2010-06-06 13:05:32
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ben1147

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
scelab(金币+1):欢迎多来交流！:tiger06: 2010-06-06 17:29:08
这个找本生物信息学偏软件应用方面的书就行了
要是本来就不清楚，文献越看越晕

经典文献当然就是这些软件作者发的了
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7楼2010-06-06 13:36:35
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JAuu

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by ben1147 at 2010-06-06 13:36:35:
这个找本生物信息学偏软件应用方面的书就行了
要是本来就不清楚，文献越看越晕

经典文献当然就是这些软件作者发的了

多谢指点~
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8楼2010-06-07 09:35:41
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xiadongliang

金虫 (正式写手)
DNA序列不就可以了吗？
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9楼2010-06-07 14:40:46
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xuezhen

银虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
看天(金币+3):新虫鼓励 2010-07-04 10:56:20
看天(金币-2):评分失误不好意思 2010-07-04 10:56:46
EBI上面也可以做的，呵呵！
赞一下(3人) 回复此楼
10楼2010-06-07 19:38:59
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