应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】codehop设计的引物怎么修改？
101/1返回列表
查看: 1605  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

sai00fuji

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】codehop设计的引物怎么修改？ 已有7人参与

codehop设计的引物在5‘端没有简并，这是他的特点。。。
导师说5’端还是要做简并的，毕竟有几个位置不同的碱基是1：1分布的。我的担心是：这样子做codehop的特点不就没了嘛

想问问大家做codehop的时候是怎么修改引物的
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-05-29 14:31:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sai00fuji

金虫 (正式写手)
有经验的同学们给点建议呀~
赞一下 回复此楼
2楼2010-05-29 22:32:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

longfeng

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
不修改，直接用。我的直接就出来了
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2010-05-29 23:00:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

证明题

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+2):热心虫友~~感谢交流~~ 2010-05-30 13:28:51
试试genefisher~
http://bibiserv.techfak.uni-biel ... er2/submission.html
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2010-05-30 04:52:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sai00fuji

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by longfeng at 2010-05-29 23:00:12:
不修改，直接用。我的直接就出来了

可是5‘端不是都保守的呀，不改没关系吗
赞一下 回复此楼
5楼2010-05-31 21:28:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

longfeng

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
没关系的
回复此楼
6楼2010-06-07 20:49:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

szylnl

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by longfeng at 2010-05-29 23:00:12:
不修改，直接用。我的直接就出来了

我有一些蛋白肽段，想根据这些设计简并引物，怎么用codehop啊？直接输入后没有结果啊？
谢谢！！！
赞一下(1人) 回复此楼
用百分之百的努力去做每件事
7楼2011-04-27 19:35:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zengrong061

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by szylnl at 2011-04-27 19:35:22:
我有一些蛋白肽段，想根据这些设计简并引物，怎么用codehop啊？直接输入后没有结果啊？
谢谢！！！

应该要做一个比对，形成Blockmaker 格式的才行
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2011-06-14 17:14:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ample1007

银虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我最近在学习设计CODEHOP简并引物，具体步骤如下：
先在genebank上找到你的目的基因，当然这个基因应该是蛋白基因而不是核酸序列；
接着进行block比对，建议结合clustralW，看保守区的具体位置；
blockmaker下面有CODEHOP链接的按钮，点击进去；
结合文献进行相应参数的设置；
然后look for primer；
然后就出来很多结果，不同的保守区有不同的很多引物序列，前面的是正向引物，互补的是方向引物，直接合成就行。
至于，如何用OLIGO 6对引物进行评估，我现在还不会。
期待高人进行解释！
赞一下 回复此楼
9楼2012-09-02 09:12:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Crescendo

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
9楼: Originally posted by ample1007 at 2012-09-02 09:12:09
我最近在学习设计CODEHOP简并引物，具体步骤如下：
先在genebank上找到你的目的基因，当然这个基因应该是蛋白基因而不是核酸序列；
接着进行block比对，建议结合clustralW，看保守区的具体位置；
blockmaker下面 ...

朋友你好！我请问一下为什么我通过CODEHOP给出的引物PCR不出来靶标序列？求教！
赞一下 回复此楼
日拱一卒，功不唐捐
10楼2014-01-09 18:04:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 sai00fuji 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 278求调剂 +9 烟火先于春 2026-03-17 9/450 2026-03-21 17:47 by 学员8dgXkO
[考研] 0703化学297求调剂 +3 Daisy☆ 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:45 by ColorlessPI
[考研] 能源材料化学课题组招收硕士研究生8-10名 +5 脱颖而出 2026-03-16 15/750 2026-03-21 10:16 by 脱颖而出
[考研] 301求调剂 +10 yy要上岸呀 2026-03-17 10/500 2026-03-21 03:14 by JourneyLucky
[考研] 材料专业求调剂 +6 hanamiko 2026-03-18 6/300 2026-03-21 00:24 by JourneyLucky
[考研] 311求调剂 +5 冬十三 2026-03-18 5/250 2026-03-21 00:16 by JourneyLucky
[考研] 296求调剂 +6 www_q 2026-03-18 10/500 2026-03-20 23:56 by JourneyLucky
[考研] 一志愿中海洋材料工程专硕330分求调剂 +8 小材化本科 2026-03-18 8/400 2026-03-20 23:16 by JourneyLucky
[考研] 287求调剂 +7 晨昏线与星海 2026-03-19 8/400 2026-03-20 22:19 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +7 ^O^乜 2026-03-19 7/350 2026-03-20 21:43 by JourneyLucky
[考研] 260求调剂 +3 朱芷琳 2026-03-20 3/150 2026-03-20 20:35 by 学员8dgXkO
[考研] 材料与化工专硕调剂 +7 heming3743 2026-03-16 7/350 2026-03-20 19:31 by zhukairuo
[考研] 086500 325 求调剂 +3 领带小熊 2026-03-19 3/150 2026-03-20 18:38 by 尽舜尧1
[考研] 一志愿中国海洋大学，生物学，301分，求调剂 +5 1孙悟空 2026-03-17 6/300 2026-03-19 23:46 by zcl123
[考研] 材料考研调剂 +3 xwt。 2026-03-19 3/150 2026-03-19 11:22 by w沐阳w
[考研] 本科郑州大学物理学院，一志愿华科070200学硕，346求调剂 +4 我不是一根葱 2026-03-18 4/200 2026-03-19 09:11 by 浮云166
[考研] 290求调剂 +3 p asserby. 2026-03-15 4/200 2026-03-17 16:35 by wangkm
[考博] 26申博 +4 八6八68 2026-03-16 4/200 2026-03-17 13:00 by 轻松不少随
[考研] 0856求调剂 +3 刘梦微 2026-03-15 3/150 2026-03-16 10:00 by houyaoxu
[考研] 0856专硕279求调剂 +5 加油加油！? 2026-03-15 5/250 2026-03-15 11:58 by 2020015
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭