应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 【求助/交流】求高人指点：RNA打断的原理
91/1返回列表
查看: 3508  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

holyala

木虫 (著名写手)

砖家

[交流] 【求助/交流】求高人指点：RNA打断的原理 已有4人参与

RNA在构建测序文库前通常需要打断成一定大小的片段然后再做后续步骤
实验室用的打断试剂为Ambion的Fragmentation Reagent
主要成分是Tris acetate，KOAc and MgOAc，pH 8.1
最近跟同事讨论该试剂打断RNA的原理，但是一直没有结果，故求高人指点~~~呵呵
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-05-19 17:43:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhwenxing

木虫 (著名写手)

尛森蟲
holyala(金币+1): 2010-05-25 11:38:27
去  华大基因 问问吧，他们应该很清楚这个。以前建库，没有用这种方法。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-05-19 17:52:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

holyala

木虫 (著名写手)

砖家
引用回帖:
Originally posted by zhwenxing at 2010-05-19 17:52:14:
去  华大基因 问问吧，他们应该很清楚这个。以前建库，没有用这种方法。

呵呵，谢谢！不过...俺就是混华大的，和我讨论这个问题的同事正是做转录组文库构建的~~我们也有很多欠缺的知识啊。
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2010-05-19 18:29:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

linxi8579

铜虫 (正式写手)
holyala(金币+1): 2010-05-25 11:38:33
你就是华大的，你们也做小RNA测序是吧，前段时间你们搞讲座我问了一下测一个要一万五左右，能便宜到什么程度啊。还有你们可不可以告诉我测序的具体流程，这样我们在准备样品时也好注意，我正想给你们打电话呢。
赞一下 回复此楼
4楼2010-05-19 21:32:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

holyala

木虫 (著名写手)

砖家
引用回帖:
Originally posted by linxi8579 at 2010-05-19 21:32:25:
你就是华大的，你们也做小RNA测序是吧，前段时间你们搞讲座我问了一下测一个要一万五左右，能便宜到什么程度啊。还有你们可不可以告诉我测序的具体流程，这样我们在准备样品时也好注意，我正想给你们打电话呢。

恩，价格方面我不好说，因为我是研发部的，价格得和市场部的同事谈哦。
至于small RNA测序的流程，简单来说就是PAGE电泳分离、切胶回收目的片段，加测序接头，反转录成DNA，文库检测，上机测序。准备样品的话，small RNA组对样品接收有专门的标准，你可以参考他们的标准进行制备。
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2010-05-20 10:15:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

linxi8579

铜虫 (正式写手)
非常感谢您的回复啊，流程我在文献里看到过这些，但是反转成cDNA后还要与文库检测，这步是如何进行的呢？谢谢啦。
赞一下 回复此楼
6楼2010-05-20 18:38:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

holyala

木虫 (著名写手)

砖家
引用回帖:
Originally posted by linxi8579 at 2010-05-20 18:38:24:
非常感谢您的回复啊，流程我在文献里看到过这些，但是反转成cDNA后还要与文库检测，这步是如何进行的呢？谢谢啦。

文库检测就是做Aglient Bioanalyzer 2100和qPCR，2100检测是为了确定片段大小是否合适，qPCR则是为了定量以便上机组确定使用量和稀释倍数。这些工作都不需客户来做啊，只要送样过来，后面的建库和检测工作都有专人负责的。

呃..我们跑偏了~~我发这个帖是为了求RNA打断原理的呀


[ Last edited by holyala on 2010-5-21 at 10:53 ]
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2010-05-21 10:52:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jasco

木虫 (正式写手)
holyala(金币+1): 2010-05-25 11:38:40
帮顶，顺便学习
回复此楼
8楼2010-05-21 11:14:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

linxi8579

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by holyala at 2010-05-21 10:52:02:


文库检测就是做Aglient Bioanalyzer 2100和qPCR，2100检测是为了确定片段大小是否合适，qPCR则是为了定量以便上机组确定使用量和稀释倍数。这些工作都不需客户来做啊，只要送样过来，后面的建库和检测工作都有 ...

呵呵，谢谢啦。
回复此楼
9楼2010-05-22 22:03:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 holyala 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上） +4 gdd2018 2026-08-28 5/250 2026-08-28 12:41 by Tide man
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+5) +12 晴天加油 2026-08-26 13/650 2026-08-28 11:32 by skyjudy
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难 +10 Kittylucky 2026-08-27 11/550 2026-08-28 10:45 by Kittylucky
[基金申请] 哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[教师之家] 导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！ +7 苏东坡二世 2026-08-23 7/350 2026-08-27 18:14 by 瞬息宇宙
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 基金未中，这种答复是模板吗？ +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 我不理解！ +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +22 羊腰板 2026-08-21 25/1250 2026-08-26 15:00 by zuocuiping
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 今天务委会开完了，明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 明天应该可查了！？ +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭