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happy8506

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】DNase 处理 RNA 的具体步骤(不用试剂盒) 已有4人参与

请教一下用DNase 处理 RNA ,除去DNA的详细步骤,最好是不用试剂盒的。谢谢!
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linxi8579

铜虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我用的 Takara的DNA酶,效果挺好,但是要反映一个半到两个小时,不过这两天我的实验有点问题,RNA有些降解,DNA除的也不非常干净,就是第一次做得好,我怀疑我的酶还有抑制剂可能活性都不行了啊?
8楼2010-05-20 18:56:23
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holyala

木虫 (著名写手)

砖家

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+3):欢迎多多交流~~ 2010-05-19 18:52:29
1) 取10μgRNA样品置于RNase–free的EP管中,进行DNA消化。一般采用20μL体系。
RNA                       10 μg
DEPC水                    n μL
10×DNase I Buffer     2 μL
DNase I                    2 μL
Total volume             20 μL

2)37 ℃,反应10min。

3)加入2μL 1mM EDTA,75 ℃变性10min,冰上冷却。

4)补水至100μL(78μL DEPC–H2O),加入10μL 3M NaAC,2μL糖原,混匀后加入2.5倍体积的无水乙醇,再次混匀,-80 ℃静置30min沉淀RNA,13000 rpm 4 ℃离心20min。70%乙醇(DEPC–H2O配制)洗涤并13000 rpm离心5min。稍微晾干后用DEPC–水溶解沉淀。
2楼2010-05-19 17:25:04
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zhwenxing

木虫 (著名写手)

尛森蟲

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+3):欢迎多多交流~~ 2010-05-19 18:51:58
1、首先要打开RNA 的二级结构。70-72℃10min后立刻冰冷。
2、体系有大有小根据说明书来就可以了。
3、特别注意DNAse的浓度!也就是单位数,一般稀释后使用,1/1000有时候就足够啦。
4、过柱子法或者沉淀法回收RNA,肯定会有不少损失的~多准备点RNA哈~

祝福好运!
3楼2010-05-19 17:49:12
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happy8506

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by holyala at 2010-05-19 17:25:04:
1) 取10μgRNA样品置于RNase–free的EP管中,进行DNA消化。一般采用20μL体系。
RNA                       10 μg
DEPC水                    n μL
10×DNase I Buffer     2 μL
DNase I       ...

谢谢,可是一定要加糖原吗?
4楼2010-05-19 18:15:03
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