应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】水盒子问题
51/1返回列表
查看: 2731  |  回复: 17
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

574384607

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】水盒子问题 已有12人参与

文献中加的是spc水溶液，和自己建的有什么不同？namd中本身就自带这种类型的水吗，我现在还没用namd
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-05-16 09:36:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qzhaosdu

金虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-05-20 17:44:55
引用回帖:
Originally posted by bay__gulf at 2010-05-16 11:14:55:

影响肯定有, 大不大看体系而定
我不清楚ms 的水类型, 但知道它可以自动分配力场的
把结构建立起来就行, 剩下的让ms 来做吧

MS里可以改输入文件改变水分子立场类型。
赞一下(2人) 回复此楼
Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
7楼2010-05-16 18:02:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 18 个回答

chenshixua

木虫 (正式写手)
这个真的不清楚，抱歉
赞一下 回复此楼
2楼2010-05-16 10:27:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

574384607

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by chenshixua at 2010-05-16 10:27:28:
这个真的不清楚，抱歉

thank you all the same
赞一下 回复此楼
3楼2010-05-16 10:56:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州
★ ★
574384607(金币+1): 2010-05-16 11:01:14
lei0736(金币+2):谢谢 2010-05-16 16:59:36
namd (准确说是vmd) 默认添加的是tip3p, 这个和spc 力场极为相似只有几个参数的不同
如果用charmm 力场, 推荐使用tip3p, 因为charmm 力场的参数是在tip3p 下拟合得到的, 这个最准确
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-05-16 10:57:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 18 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭