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xscxscxsc

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】将MS数据文件转化成lammps data 已有21人参与

大家好!我是个lammps新手,最近想用materials studio建模转化成lammps data文件,我是用lammps里的msi2lmp工具转化的,在MS中我指定的cvff力场,但是我最后想计算的不是这个力场,所以用lammps计算失败,那我我应该怎样在文件中修改呢,希望大家能给个相信的步骤,谢谢了!
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xscxscxsc

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by hongyesies at 2010-06-02 09:44:50:
仔细看manual,按照固定格式修改,不要过分依赖现成程序啊。

恩,这个问题我已经解决了,但同样谢谢你的回复啊!
3楼2010-06-02 12:06:22
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hongyesies

金虫 (正式写手)

红叶

★ ★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-06-02 09:59:26
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-06-02 10:01:09
仔细看manual,按照固定格式修改,不要过分依赖现成程序啊。
2楼2010-06-02 09:44:50
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amynihao

金虫 (正式写手)

寂寞大虫


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by xscxscxsc at 2010-06-02 12:06:22:

恩,这个问题我已经解决了,但同样谢谢你的回复啊!

您好,您这个问题我也想知道,能不能告诉我呢,非常感谢。
不是要做一个单纯优秀的人,而是要做一个不可替代的人。
4楼2011-01-22 15:49:19
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lili19820118

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
楼主能不能说一下具体转化的步骤啊,为什么我按照说明测试
  % setenv BIOSYM_LIBRARY ../biosym_frc_files
   % ../src/msi2lmp.exe nylon -class I -frc cvff > data.nylon
   % ../src/msi2lmp.exe crambin -class I -frc cvff > data.crambin
   % ../src/msi2lmp.exe phen3_cff97 -class II -frc cff91 > data.phen3_cff97
时,第一步就出问题了,
% setenv BIOSYM_LIBRARY ../biosym_frc_files 时出现,
-bash: setenv: command not found
在进行下一步就说
Cannot open cvff.frc
先谢谢了
5楼2011-02-14 17:29:37
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