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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【讨论】如何进行小分子结构文件格式的转化
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zjz660964

铁虫 (初入文坛)

[交流] 【讨论】如何进行小分子结构文件格式的转化 已有4人参与

有些格式的小分子结构数据文件可以包含多个小分子，比如mol2和sdf文件等。那么这些包含多个分子的小分子结构数据文件之间如何进行格式转化呢？比如sdf和mol2之间如何转换。还有如何对进行这些多分子文件进行拆分和组合呢？谢谢大家啦。
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1楼 2010-07-10 18:42:53
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fmtzhangli

金虫 (小有名气)
★ ★
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lei0736(金币+1):谢谢 2010-07-12 13:41:21
用openbabel转换格式
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2楼2010-07-11 10:42:16
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
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lei0736(金币+1):谢谢 2010-07-12 13:41:30
这个问题，已经被回答了无数遍了，LZ如果勤快点，学会用站内搜索，很简单。省得动不动就求助，还没有人搭理气恼。
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除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
3楼2010-07-11 15:43:02
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
★ ★
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lei0736(金币+1):谢谢 2010-07-12 13:41:37
看看Gasteiger的《化学信息学简明教程》，就感到实在不好意思了。
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4楼2010-07-11 17:32:46
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zjz660964

铁虫 (初入文坛)
是这样的，我用openbabel转了，但包含的分子数太多，根本没法转。
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5楼2010-07-11 19:06:18
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zjz660964

铁虫 (初入文坛)
我的单个mol2文件包含差不多四万多个分子，一跑就死机。
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6楼2010-07-11 19:12:56
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fmtzhangli

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
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ghcacj(金币+2):谢谢 2010-09-01 10:00:12
引用回帖:
Originally posted by zjz660964 at 2010-07-11 19:12:56:
我的单个mol2文件包含差不多四万多个分子，一跑就死机。

linux上命令运行不会死机吧
win上不知道能不能命令运行。。。
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7楼2010-08-31 22:09:48
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