24小时热门版块排行榜    

查看: 1409  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

水月慧心

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】dmol搜索过渡态的出现固定原子无法配对问题 已有1人参与

请教大家一个问题: 在搜索过渡态时候出现这个问题  

Error: Fixed coordinate mismatch:    2.195527   2.442696
Error: Fixed coordinates should match in both structures to within     0.0010
Message: DMol3 job failed
Error: DMol3 exiting
我在反应物和生成物中都有固定原子,可是我一一对照了 反应物和产物中固定原子的坐标都是一样的,在进行原子配对的时候没有出现问题 可是一运算就出现这个错误,要是固定原子的坐标不一样,在原子配对的时候就应该没办法进行,为什么我能进行原子配对,当运行计算的时候仍会出现这个问题呢?希望大家能帮帮我
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rik203

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请问您这个问题是怎么解决的呢?
岂能尽如人意,但求竭尽所能
4楼2013-08-03 10:52:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

zeozhou

木虫 (小有名气)

★ ★
aylayl08(金币+2):谢谢你的建议欢迎讨论 2010-03-19 08:06
水月慧心(金币+1): 2010-07-07 12:31:03
这个错误我也遇到过,明明是固定了,但是反应物和产物都会有坐标变化。我的做法是,取优化后的反应物(或产物),重新构建产物(或反应物)来进行优化计算,最后得到的结构再去拿来配对找过渡态。
2楼2010-03-18 21:55:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

水月慧心

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zeozhou at 2010-03-18 21:55:21:
这个错误我也遇到过,明明是固定了,但是反应物和产物都会有坐标变化。我的做法是,取优化后的反应物(或产物),重新构建产物(或反应物)来进行优化计算,最后得到的结构再去拿来配对找过渡态。

我的产物就是把优化好后的反应物复制过来 然后再做改动的,当然改动的地方都是未固定的原子部分,可是仍旧会出现这样的问题,怎么办呢?能再进一步讨论吗? 谢谢
3楼2010-07-07 12:30:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

水月慧心

金虫 (正式写手)

额 我忘记了 好像解决不了 干脆不固定
5楼2013-08-12 10:42:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +3 a089 2026-08-26 4/200 2026-08-27 08:25 by ZJTJZ
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +15 爱看书的可乐 2026-08-26 17/850 2026-08-27 08:24 by xxniao123
[基金申请] 基金不中,共勉 +6 eulota 2026-08-26 6/300 2026-08-27 08:00 by zzuzxg
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 LIbGuocjEEYw 2026-08-26 4/200 2026-08-27 04:33 by Ie9AyIAvGbvs
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +22 羊腰板 2026-08-21 25/1250 2026-08-26 15:00 by zuocuiping
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +4 yuleib84 2026-08-26 5/250 2026-08-26 13:40 by yuleib84
[基金申请] 科研孤儿太难了 +21 我4大白菜 2026-08-20 22/1100 2026-08-26 11:29 by nlgza
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 22/1100 2026-08-25 15:36 by 医学老男孩
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
请填处理意见