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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】dmol搜索过渡态的出现固定原子无法配对问题
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水月慧心

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】dmol搜索过渡态的出现固定原子无法配对问题 已有1人参与

请教大家一个问题： 在搜索过渡态时候出现这个问题  

Error: Fixed coordinate mismatch:    2.195527   2.442696
Error: Fixed coordinates should match in both structures to within     0.0010
Message: DMol3 job failed
Error: DMol3 exiting
我在反应物和生成物中都有固定原子，可是我一一对照了 反应物和产物中固定原子的坐标都是一样的，在进行原子配对的时候没有出现问题 可是一运算就出现这个错误，要是固定原子的坐标不一样，在原子配对的时候就应该没办法进行，为什么我能进行原子配对，当运行计算的时候仍会出现这个问题呢？希望大家能帮帮我
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1楼 2010-03-17 20:10:20
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zeozhou

木虫 (小有名气)
★ ★
aylayl08(金币+2):谢谢你的建议欢迎讨论 2010-03-19 08:06
水月慧心(金币+1): 2010-07-07 12:31:03
这个错误我也遇到过，明明是固定了，但是反应物和产物都会有坐标变化。我的做法是，取优化后的反应物（或产物），重新构建产物（或反应物）来进行优化计算，最后得到的结构再去拿来配对找过渡态。
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2楼2010-03-18 21:55:21
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水月慧心

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zeozhou at 2010-03-18 21:55:21:
这个错误我也遇到过，明明是固定了，但是反应物和产物都会有坐标变化。我的做法是，取优化后的反应物（或产物），重新构建产物（或反应物）来进行优化计算，最后得到的结构再去拿来配对找过渡态。

我的产物就是把优化好后的反应物复制过来 然后再做改动的，当然改动的地方都是未固定的原子部分，可是仍旧会出现这样的问题，怎么办呢？能再进一步讨论吗？ 谢谢
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3楼2010-07-07 12:30:58
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rik203

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问您这个问题是怎么解决的呢？
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岂能尽如人意，但求竭尽所能
4楼2013-08-03 10:52:21
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水月慧心

金虫 (正式写手)
额 我忘记了 好像解决不了 干脆不固定
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5楼2013-08-12 10:42:18
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