24小时热门版块排行榜    

查看: 1505  |  回复: 4

水月慧心

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】dmol搜索过渡态的出现固定原子无法配对问题 已有1人参与

请教大家一个问题: 在搜索过渡态时候出现这个问题  

Error: Fixed coordinate mismatch:    2.195527   2.442696
Error: Fixed coordinates should match in both structures to within     0.0010
Message: DMol3 job failed
Error: DMol3 exiting
我在反应物和生成物中都有固定原子,可是我一一对照了 反应物和产物中固定原子的坐标都是一样的,在进行原子配对的时候没有出现问题 可是一运算就出现这个错误,要是固定原子的坐标不一样,在原子配对的时候就应该没办法进行,为什么我能进行原子配对,当运行计算的时候仍会出现这个问题呢?希望大家能帮帮我
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zeozhou

木虫 (小有名气)

★ ★
aylayl08(金币+2):谢谢你的建议欢迎讨论 2010-03-19 08:06
水月慧心(金币+1): 2010-07-07 12:31:03
这个错误我也遇到过,明明是固定了,但是反应物和产物都会有坐标变化。我的做法是,取优化后的反应物(或产物),重新构建产物(或反应物)来进行优化计算,最后得到的结构再去拿来配对找过渡态。
2楼2010-03-18 21:55:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

水月慧心

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zeozhou at 2010-03-18 21:55:21:
这个错误我也遇到过,明明是固定了,但是反应物和产物都会有坐标变化。我的做法是,取优化后的反应物(或产物),重新构建产物(或反应物)来进行优化计算,最后得到的结构再去拿来配对找过渡态。

我的产物就是把优化好后的反应物复制过来 然后再做改动的,当然改动的地方都是未固定的原子部分,可是仍旧会出现这样的问题,怎么办呢?能再进一步讨论吗? 谢谢
3楼2010-07-07 12:30:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rik203

金虫 (小有名气)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请问您这个问题是怎么解决的呢?
岂能尽如人意,但求竭尽所能
4楼2013-08-03 10:52:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

水月慧心

金虫 (正式写手)

额 我忘记了 好像解决不了 干脆不固定
5楼2013-08-12 10:42:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 水月慧心 的主题更新
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 uKOSCocCb6Fm 2026-11-12 7/350 2026-11-15 03:10 by xSrQNSSjcgoX
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 uKOSCocCb6Fm 2026-11-12 6/300 2026-11-15 02:59 by xSrQNSSjcgoX
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 uKOSCocCb6Fm 2026-11-12 7/350 2026-11-15 02:48 by xSrQNSSjcgoX
[文学芳草园] 厉娜 +4 张丹枫1991 2026-11-09 6/300 2026-11-15 00:48 by Equinoxhua
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +7 0TEMgxdT1eIw 2026-11-09 10/500 2026-11-15 00:39 by Equinoxhua
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 6/300 2026-11-15 00:27 by Equinoxhua
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 TZqyNTBa07NP 2026-11-13 3/150 2026-11-14 20:11 by KXypaGgBBlw7
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 TZqyNTBa07NP 2026-11-13 3/150 2026-11-14 16:09 by KXypaGgBBlw7
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 gRND4NVAZ8VG 2026-11-11 5/250 2026-11-13 11:15 by Equinoxhua
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +6 FChKX8meu1ds 2026-11-09 10/500 2026-11-13 11:08 by Equinoxhua
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +5 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 6/300 2026-11-13 11:04 by Equinoxhua
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 4/200 2026-11-12 12:51 by ECLTXnJnRSXf
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 4/200 2026-11-12 12:28 by ECLTXnJnRSXf
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-11 5/250 2026-11-12 11:44 by HajghKOMynmz
[基金申请] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 7/350 2026-11-12 11:33 by HajghKOMynmz
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 FChKX8meu1ds 2026-11-09 8/400 2026-11-12 09:41 by HajghKOMynmz
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 gRND4NVAZ8VG 2026-11-11 3/150 2026-11-12 07:42 by HajghKOMynmz
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 6/300 2026-11-12 06:03 by 9fOTqj074tIg
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 FChKX8meu1ds 2026-11-09 7/350 2026-11-12 05:19 by 9fOTqj074tIg
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 9/450 2026-11-12 04:57 by 9fOTqj074tIg
信息提示
请填处理意见