应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】dmol搜索过渡态的出现固定原子无法配对问题
51/1返回列表
查看: 1153  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

水月慧心

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】dmol搜索过渡态的出现固定原子无法配对问题 已有1人参与

请教大家一个问题： 在搜索过渡态时候出现这个问题  

Error: Fixed coordinate mismatch:    2.195527   2.442696
Error: Fixed coordinates should match in both structures to within     0.0010
Message: DMol3 job failed
Error: DMol3 exiting
我在反应物和生成物中都有固定原子，可是我一一对照了 反应物和产物中固定原子的坐标都是一样的，在进行原子配对的时候没有出现问题 可是一运算就出现这个错误，要是固定原子的坐标不一样，在原子配对的时候就应该没办法进行，为什么我能进行原子配对，当运行计算的时候仍会出现这个问题呢？希望大家能帮帮我
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-03-17 20:10:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zeozhou

木虫 (小有名气)
★ ★
aylayl08(金币+2):谢谢你的建议欢迎讨论 2010-03-19 08:06
水月慧心(金币+1): 2010-07-07 12:31:03
这个错误我也遇到过，明明是固定了，但是反应物和产物都会有坐标变化。我的做法是，取优化后的反应物（或产物），重新构建产物（或反应物）来进行优化计算，最后得到的结构再去拿来配对找过渡态。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-03-18 21:55:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

水月慧心

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zeozhou at 2010-03-18 21:55:21:
这个错误我也遇到过，明明是固定了，但是反应物和产物都会有坐标变化。我的做法是，取优化后的反应物（或产物），重新构建产物（或反应物）来进行优化计算，最后得到的结构再去拿来配对找过渡态。

我的产物就是把优化好后的反应物复制过来 然后再做改动的，当然改动的地方都是未固定的原子部分，可是仍旧会出现这样的问题，怎么办呢？能再进一步讨论吗？ 谢谢
赞一下 回复此楼
3楼2010-07-07 12:30:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rik203

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问您这个问题是怎么解决的呢？
赞一下 回复此楼
岂能尽如人意，但求竭尽所能
4楼2013-08-03 10:52:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

水月慧心

金虫 (正式写手)
额 我忘记了 好像解决不了 干脆不固定
赞一下 回复此楼
5楼2013-08-12 10:42:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 水月慧心 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭