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jyzhenwy

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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80楼: Originally posted by zyj8119 at 2010-04-16 17:03:18
再来问一下,如果做得是整个盒子的CONFIG,但是FIELD却是单个分子的,是不是就跑步起来?怎么样才能把整个的盒子的FIELD文件生成出来?

我也有同样的困惑,不知这个人问题,您知道了么?
91楼2013-06-01 10:12:24
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nansh13

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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4楼: Originally posted by 老虎大王 at 2010-01-25 09:45:24
难处在于,谁肯费这个时间教你呢?你多少也应该自己学一些,然后就某一点难以解决之处来提问。如果叫人家给你写个通盘的教程,给你个完整的例子,换了你,你愿意干么?就算你愿意,你有那个时间么?大家都很忙啊。
...

你好   我怎么感觉最难的config文件在4.06版本手册里讲解的最少了
没找到怎么生成config
苦心人天不负卧薪尝胆三千越甲可吞吴
92楼2014-08-22 14:51:22
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nansh13

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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7楼: Originally posted by tpp001 at 2010-01-25 16:13:30
非常感谢你的回复,我这里又有几个问题请教
1.对于体系的config 文件的生成,我打算这样来做:
   用ms来建立我的体系的初试结构.然后导出一个xyz坐标的文件, 既然dl_poly要求盒子的中心是体系的原点,而ms中原点在 ...

你好  麻烦问一下   我是刚开始学dl-poly   手册里面relaxation这个单词具体到应用时怎么翻译的

谢谢了
苦心人天不负卧薪尝胆三千越甲可吞吴
93楼2014-08-22 14:53:38
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nansh13

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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15楼: Originally posted by 小润猪 at 2010-02-03 03:02:38
关于CONFIG文件生成,有很多方法,可以用MS,也可以用metadise、gulp、discovery studio 等,这些软件都可以实现这个功能。说白了CONFIG 就是些原子坐标,简单分子甚至可以自己计算着写上去。
CONFIG 与FIELD 文件 ...

你好   麻烦问你一个问题    我现在学习dl-poly软件的困难越是config文件的建立    不知道用哪个软件生成比较好
我是做非晶玻璃材料的
谢谢你能回答
苦心人天不负卧薪尝胆三千越甲可吞吴
94楼2014-08-22 14:58:18
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蓝之羽印

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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93楼: Originally posted by nansh13 at 2014-08-22 14:53:38
你好  麻烦问一下   我是刚开始学dl-poly   手册里面relaxation这个单词具体到应用时怎么翻译的

谢谢了...

relaxation 有豫驰的意思,系统由一个平衡态到达另一个平衡态,应该是这个样的
生命不息,奋斗不止
95楼2014-10-09 16:18:11
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小范范1989

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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90楼: Originally posted by tpp001 at 2010-05-05 17:00:22
在 dl_poly手册中关于Potential Of mean Force Constraints,有这样的描述
If a number of simulations are conducted with the system constrained to different points along the reaction coordinate then t ...

咨询一下楼主,这个软件,我从网上看安装,也没学会。
不知道如何安装在linux下面,谢谢楼主,能投提供一下指点。
我现在只会解压文件,谢谢楼主了
It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
96楼2016-07-11 11:20:13
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小范范1989

木虫 (著名写手)

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22楼: Originally posted by 老虎大王 at 2010-03-06 19:08:51
是的,没有运行完。只走了五步。原因不详。

大王你好,我现在在我的linux集群上安装不上,能否提供一下安装的过程,有没有相关的资料?谢谢大王
It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
97楼2016-07-11 11:21:23
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无根的一代

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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11楼: Originally posted by tpp001 at 2010-01-27 21:58:11
不好意思,又有问题麻烦你了.
我用ms建立我的体系以后生成了一个带有xyz坐标的文件*.pdb
我想通过编程把里面的格式给修改成config格式.
config中原子的坐标的格式是下面这样的.
CT               1
    -5.36 ...

请问可以把你编的程序给共享一下可以吗?
98楼2016-11-22 10:38:05
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无根的一代

新虫 (初入文坛)

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23楼: Originally posted by zhangsongquan at 2010-03-07 21:31:58
用GUI生成CONFIG文件比较好,编程也行,注意一下格式就好了

GUI是什么?
99楼2016-11-22 10:41:49
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