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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 【求助】DL_POLY的config文件如何生成??
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tpp001

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2010-03-22 09:08:06:

兄弟，你有自己写的实例程序吗？让我看看？我还不知道这个程序怎么写？

什么程序啊?
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迷茫在知识的海洋里，需要你的指导。thankyou
41楼2010-03-22 11:57:19
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tpp001

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 老虎大王 at 2010-03-17 20:45:05:


我记得VMD好像可以打开DLPOLY的HISTORY文件。由于CONFIG和HISTORY文件很像的，大概也可以打开。另外还有一个软件叫GDIS似乎也可以。但我自己都没有用过。当然，最好还是自己把它写成PDB或者XYZ文件，这样，很 ...

不好意思又打扰您了,我想问一下,dl_poly用类似maillist这样的交流方式吗 ??
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迷茫在知识的海洋里，需要你的指导。thankyou
42楼2010-03-22 11:58:42
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老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-03-22 12:21
引用回帖:
Originally posted by tpp001 at 2010-03-22 11:58:42:

不好意思又打扰您了,我想问一下,dl_poly用类似maillist这样的交流方式吗 ??

不知道，应该是有的吧。你去他的网站上看。
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43楼2010-03-22 12:08:19
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tpp001

金虫 (著名写手)
★
lei0736(金币+1):谢谢积极交流 2010-03-23 08:54
引用回帖:
Originally posted by 老虎大王 at 2010-03-22 12:08:19:


不知道，应该是有的吧。你去他的网站上看。

谢谢您的回复,这是论坛的网址
http://www.cse.scitech.ac.uk/disco/forums/ubbthreads.php
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迷茫在知识的海洋里，需要你的指导。thankyou
44楼2010-03-22 17:00:53
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zyj8119

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by tpp001 at 2010-03-22 11:57:19:

什么程序啊?

就是怎么从MS文件生成DLPOLY文件的程序啊？什么语言的都成。
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好好学习，天天向上。
45楼2010-03-22 17:30:14
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tpp001

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2010-03-22 17:30:14:

就是怎么从MS文件生成DLPOLY文件的程序啊？什么语言的都成。

啊，其实我的体系也没有跑成功..我就是把ms生成的pdb 文件经过一系列的处理才生成CONFIG格式文件...其他的我都是自己手写的....没有固定的程序
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迷茫在知识的海洋里，需要你的指导。thankyou
46楼2010-03-22 21:33:11
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zyj8119

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by tpp001 at 2010-03-22 21:33:11:

啊，其实我的体系也没有跑成功..我就是把ms生成的pdb 文件经过一系列的处理才生成CONFIG格式文件...其他的我都是自己手写的....没有固定的程序

你怎么处理的，算法思想是？我也是想这么干，但是程序移植编不好，我用的是FORTRAN
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好好学习，天天向上。
47楼2010-03-22 21:34:59
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zyj8119

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2010-03-22 21:34:59:

你怎么处理的，算法思想是？我也是想这么干，但是程序移植编不好，我用的是FORTRAN

吧你写的实例程序发到这里看看，大家学习学习。。。
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好好学习，天天向上。
48楼2010-03-22 21:37:42
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tpp001

金虫 (著名写手)
★ ★ ★
lei0736(金币+3):谢谢 2010-03-23 08:54
引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2010-03-22 21:37:42:

吧你写的实例程序发到这里看看，大家学习学习。。。

program dlpolyinput
implicit none
integer i, numcoordinate, pbc, numatom
real, PARAMETER :: K=0
character *20 atomname, systemname
real x(200),y(200),z(200), lbox
open(20,file='CONFIG',status='unknown') !打开一个输出文件
open(1,file='input.txt',status='unknown')!打开文件，并读取
read(1,*) systemname
write(20,"(A80)" systemname
read(1,*) numcoordinate, pbc, numatom
write(20,"(I10,I10,I10)" numcoordinate, pbc, numatom
read(1,*) lbox
write(20,"(F20.3,F20.3,F20.3)" lbox, K, K
write(20,"(F20.3,F20.3,F20.3)" K, lbox, K
write(20,"(F20.3,F20.3,F20.3)" K, K, lbox
do i=1, 200
read(1,*)atomname,x(i),y(i),z(i)
write(20,"(A8,I10)" atomname, i
write(20,"(F20.3,F20.3,F20.3)"x(i), y(i) ,z(i)
end do
end
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迷茫在知识的海洋里，需要你的指导。thankyou
49楼2010-03-22 22:18:53
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tpp001

金虫 (著名写手)

这是input格式..

★
lei0736(金币+1):谢谢 2010-03-23 08:55
input-turn-config  
0         1       200
28.850
C1        -7.554        -6.98        -10.036
C2        -8.917        -7.191        -10.626
C2        -8.954        -8.558        -11.308
C2        -10.315        -8.796        -11.93
S14        -7.47        -5.332        -9.259
C1        1.742        -9.347        11.89
C2        2.961        -8.475        11.609
C2        3.55        -7.894        12.896
C2        4.758        -7.009        12.613
S14        1.068        -10.075        10.362
C1        0.999        -2.023        -3.01
C2        -0.235        -2.861        -3.327
C2        -0.654        -2.719        -4.793
C2        -1.898        -3.543        -5.105
S14        1.527        -2.224        -1.278
C1        12.82        8.949        -13.352
C2        12.856        10.457        -13.568
C2        11.448        11.052        -13.642
C2        11.484        12.558        -13.876
S14        14.495        8.247        -13.21
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50楼2010-03-22 22:20:00
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