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【求助】DL_POLY的config文件如何生成??已有9人参与
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我想模拟聚合物在金属团簇表面的吸附,想请教大家这样的体系的config文件如何生成? 另外我把手册已经看了一遍,但是希望运行一下.有么有人根据手册的算例给写一个模拟过程,给传一个谢谢!! |
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非常感谢你的回复,我这里又有几个问题请教 1.对于体系的config 文件的生成,我打算这样来做: 用ms来建立我的体系的初试结构.然后导出一个xyz坐标的文件, 既然dl_poly要求盒子的中心是体系的原点,而ms中原点在盒子的一个顶点0上,我如果把ms导出的xyz坐标，都减去盒子长度的一半就是体系的原点就在盒子的中心了，不知道这样行吗？ 2. 因为建立体系，在进行动力学模拟以前，要对体系进行relaxation。可是我不知道应该怎么样写进行optimising的control 文件，能不能给我传一个进行optimising的control模板。如果有的话，能不能顺便再给我传一个进行MD模拟的control文件。谢谢。 3. 在control文件中的 jobtime 应该怎么设定，有没有什么经验来确定一下。 |
7楼2010-01-25 16:13:30
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2楼2010-01-24 16:53:03
3楼2010-01-24 20:21:22
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4楼2010-01-25 09:45:24