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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 【讨论】最新的dlfield能够生成DL_POLY的field文件，大家用过吗？
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zyj8119

木虫 (著名写手)

[交流] 【讨论】最新的dlfield能够生成DL_POLY的field文件，大家用过吗？已有7人参与

http://pic.muchong.com/file.php?id=209
使用说明为：
http://pic.muchong.com/file.php?id=210
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好好学习，天天向上。
1楼2010-12-14 13:38:48
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043114076

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
以前下载过，试了试不太好用，就放弃了
加上我的分子都比较小，手写还可以接受就没有再尝试

[ Last edited by 043114076 on 2010-12-14 at 18:36 ]
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2楼2010-12-14 18:20:42
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zyj8119

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 043114076 at 2010-12-14 18:20:42:
以前下载过，试了试不太好用，就放弃了
加上我的分子都比较小，手写还可以接受就没有再尝试

[ Last edited by 043114076 on 2010-12-14 at 18:23 ]

我觉得还行啊，怎么难用了？不过FIELD文件也可以用免费GUI生成。
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3楼2010-12-14 18:28:12
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043114076

木虫 (正式写手)
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
另外有一个小小的疑问，DL_FIELD也是可供非商业用途免费使用的，只是需要注册一下。需要注册的原因可能是希望使用者了解软件的license，也可能是为了统计软件使用的人数方便软件的继续开发。所以我认为版主直接放在这里不太合适，不如提供一个链接，让大家自己去申请。
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4楼2010-12-14 18:36:51
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zyj8119

木虫 (著名写手)
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Originally posted by 043114076 at 2010-12-14 18:36:51:
另外有一个小小的疑问，DL_FIELD也是可供非商业用途免费使用的，只是需要注册一下。需要注册的原因可能是希望使用者了解软件的license，也可能是为了统计软件使用的人数方便软件的继续开发。所以我认为版主直接放 ...

貌似我下的时候，是不需要注册的，谁都可以下。。。。
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5楼2010-12-14 18:37:54
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043114076

木虫 (正式写手)
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Originally posted by zyj8119 at 2010-12-14 18:28:12:

我觉得还行啊，怎么难用了？不过FIELD文件也可以用免费GUI生成。

是吗？我再试试
不过，他好像只支持charmm力场吧？
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6楼2010-12-14 18:38:27
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zyj8119

木虫 (著名写手)
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zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-12-15 22:26:55
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Originally posted by 043114076 at 2010-12-14 18:38:27:

是吗？我再试试
不过，他好像只支持charmm力场吧？

不过简单的分子，用GUI生成FIELD文件，MS做构型文件，写个小程序转成DLPOLY格式，转之前，MD能量最小化一下，然后就可以开始MD。。
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7楼2010-12-14 18:41:23
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043114076

木虫 (正式写手)
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zh1987hs(金币+3):谢谢 2010-12-15 22:26:46
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Originally posted by zyj8119 at 2010-12-14 18:41:23:

不过简单的分子，用GUI生成FIELD文件，MS做构型文件，写个小程序转成DLPOLY格式，转之前，MD能量最小化一下，然后就可以开始MD。。

大致程序差不多，只是我是转之后使用dlpoly进行能量最小化的。
我一直想摆脱使用MS来生成初始文件——总是使用"偷来“的东西，心里很不爽，另外在linux下不能使用MS，只能跑到windows下使用也是很不方便的。不过好像还没有哪个软件用起来像MS那么顺手的。
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8楼2010-12-14 18:51:20
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zyj8119

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 043114076 at 2010-12-14 18:51:20:

大致程序差不多，只是我是转之后使用dlpoly进行能量最小化的。
我一直想摆脱使用MS来生成初始文件——总是使用"偷来“的东西，心里很不爽，另外在linux下不能使用MS，只能跑到windows下使用也是很不方便的 ...

DLPOLY的能量最小化不怎么样吧？貌似能量都不怎么降下去。。。
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9楼2010-12-14 18:59:16
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043114076

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zh1987hs(金币+3):谢谢 2010-12-15 22:26:34
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Originally posted by zyj8119 at 2010-12-14 18:59:16:

DLPOLY的能量最小化不怎么样吧？貌似能量都不怎么降下去。。。

怎么会呢？你用哪个关键字？
能量最小化有3个关键字可以选用，0kmd、minimization、optimazation
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10楼2010-12-14 19:18:46
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