24小时热门版块排行榜    

查看: 3529  |  回复: 6
本帖产生 1 个 模拟EPI ,点击这里进行查看

skfire

金虫 (初入文坛)

[求助] DL-Poly计算的扩散系数

想请教
以 DL-Poly 计算出来的扩散系数 diffusion coefficient
与实验结果比较相差很多的情况
各位都是以什么方法修正
让模拟结果可以与实验值符合
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

优秀版主

【答案】应助回帖

skfire(金币+2): 2011-05-20 16:53:47
那是你用的力场不合适吧。选择合适的力场或者对力场参数进行优化。
2楼2011-05-20 15:44:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

winterz

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
ghcacj(金币+3, 模拟EPI+1): 谢谢 2011-05-20 17:55:29
MD得到的扩散系数与实验值相差1-2个数量级都是正常的。
首先,MD所得的扩散系数叫self-diffusion coefficient,它与Fick diffusion coefficient有所不同。测量扩散系数的实验方法也有很多种,宏观实验方法如TEOM等得到的都是Fick diffusion coefficient,不能直接与MD结果比较。宏观扩散与微观扩散的比较我记得David Sholl在06年写过一篇account,很不错的,LZ可以找找。要想把MD的结果与实验直接比较,像QENS、PFG-NMR这样的方法得到的数据还是“可”比较的。
另外,由于扩散的模拟对体系初始构型很敏感,通常要进行ns级的长时间的模拟,对同一个体系往往要使用不同的初始构型独立模拟10遍以上,求取平均值及error bar。
3楼2011-05-20 16:19:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

skfire

金虫 (初入文坛)

感谢以上2位专家的指导
4楼2011-05-20 16:56:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xk6891

至尊木虫 (著名写手)

学习了
人生自古多险阻,勤者自得天酬助。试问否泰何所依,枯藤老枝待新抽。临渊踌躇终迈步,振翅鹏起云霄冲。似是前程甚堪忧,他日振臂揽苍穹。
5楼2011-10-24 20:34:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

longwei1221

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
83170楼: Originally posted by winterz at 2011-05-20 16:19:09
MD得到的扩散系数与实验值相差1-2个数量级都是正常的。
首先,MD所得的扩散系数叫self-diffusion coefficient,它与Fick diffusion coefficient有所不同。测量扩散系数的实验方法也有很多种,宏观实验方法如TEOM等 ...

请问DLPOLY计算扩散系数在输入文件里面需要用到哪里命令呀?是需要MSDTMP文件吧?可是这个文件是选择性输出的啊?我在那个output文件中仅仅找到了一个扩散系数和均方位移,可扩散系数为0,均方位移只有一个数据,无法进行扩散系数计算,请问你们是怎么做的呀?
愿得一人心,白首不相离
6楼2012-11-20 20:57:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

★ ★ ★
月只蓝: 金币+3, 鼓励交流! 2014-04-08 18:52:09
引用回帖:
3楼: Originally posted by winterz at 2011-05-20 16:19:09
MD得到的扩散系数与实验值相差1-2个数量级都是正常的。
首先,MD所得的扩散系数叫self-diffusion coefficient,它与Fick diffusion coefficient有所不同。测量扩散系数的实验方法也有很多种,宏观实验方法如TEOM等 ...

David Sholl的account看过了,他写的是单一和双组份在规则孔道内的扩散系数计算模拟。

对于单一和混合气体组分(没有吸附剂存在的体相扩散),不同扩散系数物理意义是什么?计算方法有什么差异?请看我最近发的几个求助帖:

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7232351&pid=1#pid1
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7230279&pid=1#pid1
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7224468&pid=1#pid1
7楼2014-04-08 08:29:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 skfire 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 深圳大学硕士招生(2026秋,传感器方向,仅录取第一志愿) +4 xujiaoszu 2026-03-11 8/400 2026-03-16 09:45 by xujiaoszu
[考研] 344求调剂 +3 knight344 2026-03-16 3/150 2026-03-16 09:42 by 无际的草原
[考研] 321求调剂 +4 大米饭! 2026-03-15 4/200 2026-03-16 08:41 by Linda Hu
[基金申请] NSFC申报书里申请人简历中代表性论著还需要在申报书最后的附件里面再上传一遍吗 20+5 NSFC2026我来了 2026-03-10 14/700 2026-03-15 23:53 by 不负韶华的虎
[考研] 中科院材料273求调剂 +3 yzydy 2026-03-15 3/150 2026-03-15 21:15 by ms629
[基金申请] 国自科面上基金字体 +4 iwuli 2026-03-12 5/250 2026-03-15 17:07 by 风云无泪
[考研] 289求调剂 +5 步川酷紫123 2026-03-11 5/250 2026-03-15 00:45 by kruisytel
[考研] 材料工程327求调剂 +3 xiaohe12w 2026-03-11 3/150 2026-03-14 20:20 by ms629
[考研] 290求调剂 +4 @将就将就看 2026-03-10 8/400 2026-03-14 14:23 by 千千运气
[考研] 331求调剂(0703有机化学 +5 ZY-05 2026-03-13 6/300 2026-03-14 10:51 by Jy?
[考研] 308 085701 四六级已过求调剂 +7 温乔乔乔乔 2026-03-12 14/700 2026-03-14 10:49 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华中农业大学071010,总分三百二,求调剂 +3 困困困困坤坤 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:35 by JourneyLucky
[考研] 0805,333求调剂 +3 112253525 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:42 by JourneyLucky
[考研] 求材料调剂 085600英一数二总分302 前三科235 精通机器学习 一志愿哈工大 +4 林yaxin 2026-03-12 4/200 2026-03-13 22:04 by 星空星月
[考研] 290求调剂 +9 ADT 2026-03-11 9/450 2026-03-13 21:55 by JourneyLucky
[考研] 0703化学一志愿211 总分320求调剂 +5 玛卡巴卡啊哈 2026-03-11 5/250 2026-03-13 21:40 by JourneyLucky
[考研] 0703化学求调剂 +7 绿豆芹菜汤 2026-03-12 7/350 2026-03-13 17:25 by njzyff
[考研] 285求调剂 +4 ytter 2026-03-12 4/200 2026-03-13 14:48 by jxchenghu
[考博] 26读博 +4 Rui135246 2026-03-12 10/500 2026-03-13 07:15 by gaobiao
[基金申请] 提交后的基金本子,已让学校撤回了,可否换口子提交 +3 dut_pfx 2026-03-10 3/150 2026-03-11 08:38 by kudofaye
信息提示
请填处理意见