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【求助】DL_POLY的config文件如何生成?? 已有9人参与
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我想模拟聚合物在金属团簇表面的吸附,想请教大家这样的体系的config文件如何生成? 另外我把手册已经看了一遍,但是希望运行一下.有么有人根据手册的算例给写一个模拟过程,给传一个谢谢!! |
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不好意思,又有问题麻烦你了. 我用ms建立我的体系以后生成了一个带有xyz坐标的文件*.pdb 我想通过编程把里面的格式给修改成config格式. config中原子的坐标的格式是下面这样的. CT 1 -5.367652772 -4.974650238 -5.990217152 -3.753414027 -2.997453843 4.469020573 -4347.618322 785.7157385 1473.633382 我想问: 在编程的输出,对于config 第一行 CT 和 1 之间的空格应该有几个合适,随便多少都合适吗? 在第二行的开头这里的空格要不要?如果要,留几个空格合适,谢谢! 还有一个疑问就是在config开头有一个变量natoms是定义原子的数目,我查看了几个例子发现这个natoms的数目和config中包含的数目不一致..有的config文件中这个变量都没有设定?这是怎么一回事? [ Last edited by tpp001 on 2010-1-27 at 22:07 ] |
11楼2010-01-27 21:58:11
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2楼2010-01-24 16:53:03
3楼2010-01-24 20:21:22
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4楼2010-01-25 09:45:24
