| 查看: 5447 | 回复: 98 | |||
| 本帖产生 1 个 模拟EPI ，点击这里进行查看 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
【求助】DL_POLY的config文件如何生成?? 已有9人参与
|
|||
|
我想模拟聚合物在金属团簇表面的吸附,想请教大家这样的体系的config文件如何生成? 另外我把手册已经看了一遍,但是希望运行一下.有么有人根据手册的算例给写一个模拟过程,给传一个谢谢!! |
回复此楼» 猜你喜欢
请问社科规划办官网上的“项目查询模块”与“项目申报模块”的账号密码一样吗？
已经有3人回复
-
用NBS溴化时溶剂除了CCl4外还有什么
已经有9人回复
-
40+中年人失业后，还能找到好工作吗？
已经有15人回复
-
二审4个多月了还是Awaiting Reviewer Scores
已经有5人回复
-
申请科研项目纯靠实力能成功吗？
已经有12人回复
-
极限拉扯，如何抉择
已经有15人回复
|
不好意思,又有问题麻烦你了. 我用ms建立我的体系以后生成了一个带有xyz坐标的文件*.pdb 我想通过编程把里面的格式给修改成config格式. config中原子的坐标的格式是下面这样的. CT 1 -5.367652772 -4.974650238 -5.990217152 -3.753414027 -2.997453843 4.469020573 -4347.618322 785.7157385 1473.633382 我想问: 在编程的输出,对于config 第一行 CT 和 1 之间的空格应该有几个合适,随便多少都合适吗? 在第二行的开头这里的空格要不要?如果要,留几个空格合适,谢谢! 还有一个疑问就是在config开头有一个变量natoms是定义原子的数目,我查看了几个例子发现这个natoms的数目和config中包含的数目不一致..有的config文件中这个变量都没有设定?这是怎么一回事? [ Last edited by tpp001 on 2010-1-27 at 22:07 ] |
11楼2010-01-27 21:58:11
老虎大王
木虫 (著名写手)
- 模拟EPI: 17
- 应助: 26 (小学生)
- 贵宾: 0.17
- 金币: 4774.1
- 散金: 8
- 红花: 42
- 帖子: 1361
- 在线: 215.2小时
- 虫号: 659094
- 注册: 2008-11-21
- 专业: 金属结构材料
2楼2010-01-24 16:53:03
3楼2010-01-24 20:21:22
老虎大王
木虫 (著名写手)
- 模拟EPI: 17
- 应助: 26 (小学生)
- 贵宾: 0.17
- 金币: 4774.1
- 散金: 8
- 红花: 42
- 帖子: 1361
- 在线: 215.2小时
- 虫号: 659094
- 注册: 2008-11-21
- 专业: 金属结构材料
4楼2010-01-25 09:45:24