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漫迹

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】双酶切连接问题

大虾们,我最近用双酶切的方法对目的片段和质粒进行连接,
步骤是:先对两者进行双酶切,切胶回收,回收后电泳条带亮度差不多,位置正确,有点暗,但是肉眼可见,试了1:5,1:7,1:9,不同比例进行连接,化转后平板上都没有目的转化子,反而有杂菌菌落,很是郁闷,帮我分析下原因吧,先谢谢了哦
补充;我连接用的是宝生物的Soulution1,时间为20个小时左右
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★ ★
amisking(金币+2,VIP+0): 12-6 17:04
漫迹(金币+1,VIP+0): 12-6 17:40
为何会有杂菌……最坏情况就是不长
电泳出来的条带明暗反映的是质量,而不是摩尔数
记得换算
是不是没有切动~~质粒好切,但是PCR产物的话,引物要设计好保护碱基,不然效率很低
2楼2009-12-06 16:21:58
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漫迹

金虫 (小有名气)

“为何会有杂菌……最坏情况就是不长
电泳出来的条带明暗反映的是质量,而不是摩尔数
记得换算
是不是没有切动~~质粒好切,但是PCR产物的话,引物要设计好保护碱基,不然     效率很低”

我酶切回收后电泳不是能看看浓度比么
目的片段P完我先连在T载体上了,也测序鉴定了,没有问题,酶切电泳后大小也是对的呢
3楼2009-12-06 16:48:23
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷

★ ★ ★ ★
amisking(金币+3,VIP+0): 12-6 17:05
漫迹(金币+1,VIP+0): 12-6 17:40
有杂菌菌落,没加抗生素,还是抗生素失效了,还是平板长的时间太长?
建议做个对照,转空载体,看看感受态是否有问题。
如果不是感受态的问题,问题就出在连接上了。
Thank-you,so-blue.
4楼2009-12-06 17:02:21
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漫迹

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by susizheng at 2009-12-6 17:02:
有杂菌菌落,没加抗生素,还是抗生素失效了,还是平板长的时间太长?
建议做个对照,转空载体,看看感受态是否有问题。
如果不是感受态的问题,问题就出在连接上了。

加了抗生素了,我转到大肠里,挑了菌落,都是球状的,我对感受态做过镜检,没问题的,问题应该出在连接上,可是又分析不出为什么连接不上
5楼2009-12-06 17:39:00
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tianpingpe

新虫 (小有名气)

★ ★ ★
漫迹(金币+1,VIP+0): 12-7 10:47
amisking(金币+2,VIP+0): 12-7 11:52
你电泳后是用什么染色的呢,如果是eb的话,有可能会降低你连接效率,最好是无eb回收,有段时间我们也是连接转化有问题,后来发现是EB量太高,影响了连接效率,还有一点是sollution i连接效率本来就比较低,需要加入的buffer太多,里面的连接产物和载体太少,最好是用t4 连接酶。载体和片段的比例是摩尔比,不是质量比。再检查一下你的酶切位点,有的时候如果没有太注意位点,比较也许基因里面有个位点,但是没有发现,但是酶切的时候切掉了,但是比较小,电泳有的时候是看不出来的,再检查下你的酶切位点。感受态你最好转化个质粒,估计下转化率。
6楼2009-12-06 22:40:59
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张晓梅ZXM

金虫 (正式写手)

meimeizhang

都是高手啊,学习了,谢谢!
每天进步一点点,持之以恒!
7楼2009-12-07 10:39:21
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漫迹

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by tianpingpe at 2009-12-6 22:40:
你电泳后是用什么染色的呢,如果是eb的话,有可能会降低你连接效率,最好是无eb回收,有段时间我们也是连接转化有问题,后来发现是EB量太高,影响了连接效率,还有一点是sollution i连接效率本来就比较低,需要加 ...

我用的就是EB染色,可能有这方面的原因,不过我的连接酶用的是TAKALA的Solution1,不用加任何buffer的,我再确认下酶切问点吧,谢谢了哦
8楼2009-12-07 10:54:49
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changes

木虫 (正式写手)


漫迹(金币+1,VIP+0): 12-8 16:18
可能是载体没切好,分步酶切试试。沉淀回收也可。
9楼2009-12-07 11:48:09
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cavafory

铁虫 (小有名气)

我最近也是做单克隆出不来

★ ★
amisking(金币+2,VIP+0): 12-7 20:26
我最近也是做单克隆出不来,郁闷死了,pcr后的片段和载体都分别切了四个小时,连接后看到板子上长出来了,可是酶切发现都没有目的带,郁闷死了,到底是哪里错了呢
10楼2009-12-07 20:25:42
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