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【求助】amber中的Distance restraint？ 已有2人参与
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大家好： 我在跑md的时候用到了nmr distance restraint，但是跑出的结果也就是out文件中出现了一下，弱弱的问一下这样正常吗？就是在250step后竟然nmr restraint 为0？ NSTEP = 0 TIME(PS) = 0.000 TEMP(K) = 0.00 PRESS = 0.0 Etot = -354165.8192 EKtot = 0.0000 EPtot = -354165.8192 BOND = 323.2417 ANGLE = 1484.8635 DIHED = 2630.5202 1-4 NB = 1853.1531 1-4 EEL = 23829.9363 VDWAALS = 62903.2679 EELEC = -447237.1261 EHBOND = 0.0000 RESTRAINT = 46.3241 EAMBER (non-restraint) = -354212.1433 Ewald error estimate: 0.1509E-03 ------------------------------------------------------------------------------ NMR restraints: Bond = 46.324 Angle = 0.000 Torsion = 0.000 =============================================================================== NSTEP = 250 TIME(PS) = 0.250 TEMP(K) = 16.33 PRESS = 0.0 Etot = -300871.8202 EKtot = 2700.2781 EPtot = -303572.0983 BOND = 374.7332 ANGLE = 1603.3394 DIHED = 2663.7262 1-4 NB = 1865.1801 1-4 EEL = 23834.0649 VDWAALS = 46987.7396 EELEC = -380900.8816 EHBOND = 0.0000 RESTRAINT = 0.0000 Ewald error estimate: 0.3079E-03 ------------------------------------------------------------------------------ NMR restraints: Bond = 0.000 Angle = 0.000 Torsion = 0.000 =============================================================================== [ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 13:26 ] |
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3楼2009-10-30 11:20:53
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