| 查看: 1099 | 回复: 6 | |||
[交流]
【求助】amber中的Distance restraint？ 已有2人参与
|
|
大家好： 我在跑md的时候用到了nmr distance restraint，但是跑出的结果也就是out文件中出现了一下，弱弱的问一下这样正常吗？就是在250step后竟然nmr restraint 为0？ NSTEP = 0 TIME(PS) = 0.000 TEMP(K) = 0.00 PRESS = 0.0 Etot = -354165.8192 EKtot = 0.0000 EPtot = -354165.8192 BOND = 323.2417 ANGLE = 1484.8635 DIHED = 2630.5202 1-4 NB = 1853.1531 1-4 EEL = 23829.9363 VDWAALS = 62903.2679 EELEC = -447237.1261 EHBOND = 0.0000 RESTRAINT = 46.3241 EAMBER (non-restraint) = -354212.1433 Ewald error estimate: 0.1509E-03 ------------------------------------------------------------------------------ NMR restraints: Bond = 46.324 Angle = 0.000 Torsion = 0.000 =============================================================================== NSTEP = 250 TIME(PS) = 0.250 TEMP(K) = 16.33 PRESS = 0.0 Etot = -300871.8202 EKtot = 2700.2781 EPtot = -303572.0983 BOND = 374.7332 ANGLE = 1603.3394 DIHED = 2663.7262 1-4 NB = 1865.1801 1-4 EEL = 23834.0649 VDWAALS = 46987.7396 EELEC = -380900.8816 EHBOND = 0.0000 RESTRAINT = 0.0000 Ewald error estimate: 0.3079E-03 ------------------------------------------------------------------------------ NMR restraints: Bond = 0.000 Angle = 0.000 Torsion = 0.000 =============================================================================== [ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 13:26 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
081700，311，求调剂
已经有18人回复
-
081700学硕，323分，一志愿中国海洋大学求调剂学校
已经有17人回复
-
085600材料与化工301分求调剂院校
已经有21人回复
-
化工学硕 285求调剂
已经有5人回复
-
0703调剂
已经有18人回复
-
0702物理学学硕299求调剂
已经有3人回复
-
304求调剂（085602，过四级，一志愿985）
已经有19人回复
-
085600材料与化工专硕329 求调剂
已经有17人回复
-
求调剂
已经有10人回复
-
生物与医药273求调剂
已经有10人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Amber10作业正常提交，但是无".mdcrd"和".rst"结果文件生成
已经有4人回复
- 高斯寻找过渡态，distance matrix出错，请高手帮我看看
已经有3人回复
- amber 保存复合物时出错
已经有3人回复
- 新手想知道如何用Amber做蛋白质分子固定某两个或多个氨基酸距离的MD计算
已经有4人回复
- 【求助】固体酸催化剂Amberlyst-15H+有没有更好的替代品
已经有7人回复
- 【求助】量子化学方法求amber力场参数
已经有10人回复
- 【求助】打算从amber学起
已经有16人回复
- 【求助】cutoff distance
已经有4人回复
- 【求助】Amber安装问题
已经有4人回复
jinlin
至尊木虫 (著名写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 22051.6
- 红花: 1
- 帖子: 1629
- 在线: 44.2小时
- 虫号: 46632
- 注册: 2004-05-29
- 专业: 冠状动脉性心脏病
2楼2009-10-29 20:32:47
3楼2009-10-30 11:20:53
4楼2010-03-30 06:52:32
tingjun
木虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 3702.4
- 帖子: 173
- 在线: 38.8小时
- 虫号: 877690
- 注册: 2009-10-19
- 性别: MM
- 专业: 化学计量学与化学信息学
5楼2010-04-20 19:31:37
zhj10.26
木虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2003.4
- 散金: 5
- 红花: 1
- 帖子: 158
- 在线: 39.5小时
- 虫号: 559067
- 注册: 2008-05-16
- 性别: MM
- 专业: 生物信息学
6楼2011-03-20 16:27:39
zhj10.26
木虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2003.4
- 散金: 5
- 红花: 1
- 帖子: 158
- 在线: 39.5小时
- 虫号: 559067
- 注册: 2008-05-16
- 性别: MM
- 专业: 生物信息学
7楼2011-03-20 16:31:35
