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lynn111666

铜虫 (初入文坛)

[求助] RT后的cDNA可以稀释吗?已有1人参与

最近做RT-PCR,但是用Takara的RR047A做RT后得到的cDNA(共20μL),如果按Takara的RR420A做PCR的话,cDNA完全不够(20μL的PCR体系,加2μLcDNA)。
那可以先把得到的cDNA先稀释下,少加点吗?
能把20μL的PCR体系改成10μL的吗?
PCR试剂盒中的ROX可以不加吗?(PCR仪器:stepone plus)
谢谢!
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030Selma

金虫 (正式写手)

cdna浓度要试了才知道,如果基因表达丰度很高的话,低点浓度为何不可?

发自小木虫IOS客户端
2楼2016-05-17 00:35:15
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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气

.............................
cDNA从来都是要稀释用的!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
cDNA从来都是要稀释用的!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
cDNA从来都是要稀释用的!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
只要你的起始量RNA按实验说明书来做(20 uL体系 1~10ug RNA)

但这不是重点!
重点是,RT后的cDNA含有众多杂质(反转录酶 buffer dNTPs Oligo等)这些对下游的PCR都是不利的。
所以需要稀释使用,做基因克隆,半定量我们一般稀释10~20倍
定量虽然不稀释,但是加的极少,一个孔加0.02ul

理论上做一次20ul体系的cDNA够你做很多很多很多很多很多很多很多很多很多实验的。
Let God do with it as He wills
3楼2016-05-17 09:43:52
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yspflyfuture

新虫 (小有名气)

请问sulfonic ROX是什么物质,cas号?
做好自己,活好每天
4楼2016-08-03 14:57:53
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prthefu

木虫 (著名写手)

还要稀释吗?我刚做了半个月的RT,都没有稀释,师兄师姐告诉我说只要得到的ct值<30就没什么问题,越稀释,模板浓度低,ct值较高

发自小木虫Android客户端
nothing is impossible in this world,if you have the will to win,you can achieve anything
5楼2016-08-03 23:24:35
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浮笙若梦

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

你有测RNA浓度和质量吗?逆转的很多试剂残留(如buffer,dNTP,引物等)对PCR会有一定的抑制作用,建议做Q的时候最开始的时候做一个梯度稀释,然后找到一个最适浓度。ROX是为了矫正孔与孔之间产生的荧光信号误差,stepone plus一般是加高浓度的,其实不加也是可以的
6楼2016-08-04 09:59:59
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