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wearethefire

新虫 (初入文坛)

[交流] 关于分子优化的问题,向各位请教 已有2人参与

大家新年好。
本人不才,做分子优化没能做出文献上的结果。
多番尝试后终于鼓起勇气向大家请教。
首先是我要模仿的实验部分
关于分子优化的问题,向各位请教
关于分子优化的问题,向各位请教-1
关于分子优化的问题,向各位请教-2
以下是我的优化
初始结构
关于分子优化的问题,向各位请教-3
结果 根据文献的DFT B3LYP 6-31+G(d,p)模拟 文件在附件
关于分子优化的问题,向各位请教-4
关于分子优化的问题,向各位请教-5
优化后出现了芳香键?而且总体能量也跟文献有较大差别。
向大家请教!


作为论坛新人,在此自我介绍一下
本人不才,仅是一中药学大四学生,在化学方面实在是一知半解。
来到量化版的原因是接受了老师的实验任务需要进行一些简单的优化及计算,
但是在一开始的初步优化便撞墙了
弱弱的说一下,由于优化没有复杂要求,一直都是直接在G view上面做的,图形化界面比较简单
请谅
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  • 2016-02-17 19:21:53, 715.86 K
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wearethefire

新虫 (初入文坛)

wearethefire: 回帖置顶 2016-02-17 21:25:17
原来要在论坛上传...
3楼2016-02-17 19:59:08
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wearethefire

新虫 (初入文坛)

2楼2016-02-17 19:57:53
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不取俗名

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
1.我推测,你所谓的芳香键指的是CN间,但是值得注意的是,判断是否是芳香键远没有想象中那么简单,这边出现键的模式,仅仅是一个软件的阀值自动判断的,也就是说并没有特别强的理论意义

2.我还是推测,你说的能量和文献差别很大,是不是你没有换算单位,要知道,文献中所使用的是kcal.mol-1,而我们计算得到的是a.u.,需要进行换算

发自小木虫Android客户端
4楼2016-02-18 11:21:08
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wearethefire

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 不取俗名 at 2016-02-18 11:21:08
1.我推测,你所谓的芳香键指的是CN间,但是值得注意的是,判断是否是芳香键远没有想象中那么简单,这边出现键的模式,仅仅是一个软件的阀值自动判断的,也就是说并没有特别强的理论意义
2.我还是推测,你说的能量和 ...

可能这个键没有意义,但原文的优化结果没有,这个让我很纠结

发自小木虫Android客户端
5楼2016-02-18 12:44:28
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