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zwnjust

至尊木虫 (职业作家)

至尊木虫

[求助] 关于分子对称性的问题，急 已有1人参与

关于分子对称性的问题，我对一种分子进行结构优化，结果显示point group为C1,而文献结算结果是C3v,所选计算方法和文献是一致的，这个是什么原因呢?谢谢啦
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至尊木虫
1楼 2014-04-09 15:49:13
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zwnjust: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢你的耐心解答，我是一个初学者，如何强制最高点群为C3V呢？对于一些未知对称性的分子怎么办呢？ 2014-04-09 19:00:42
gmy1990: 金币+2 2014-04-10 16:00:43
很正常，如果你去看优化好的坐标，可能只是小数点后面4,5位才有微小区别，这种情况下你能说它没有对称性么？在高斯里似乎是1和-1.00001就认为不对称了，你可以在计算的时候强制最高点群为C3V
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2楼2014-04-09 18:31:23
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家
★ ★
gmy1990: 金币+2 2014-04-10 16:00:48
用直角坐标或冗余内坐标做优化，对称性都有可能降低

必须用z矩阵优化（opt=Z-matrix），但是可能会遇到180度键角的问题
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beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
3楼2014-04-09 20:01:12
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zwnjust

至尊木虫 (职业作家)

至尊木虫
引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-04-09 18:31:23
很正常，如果你去看优化好的坐标，可能只是小数点后面4,5位才有微小区别，这种情况下你能说它没有对称性么？在高斯里似乎是1和-1.00001就认为不对称了，你可以在计算的时候强制最高点群为C3V

谢谢你的耐心解答，我是一个初学者，如何强制最高点群为C3V呢？对于一些未知对称性的分子怎么办呢？
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至尊木虫
4楼2014-04-09 20:07:17
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zwnjust

至尊木虫 (职业作家)

至尊木虫
引用回帖:
3楼: Originally posted by beefly at 2014-04-09 20:01:12
用直角坐标或冗余内坐标做优化，对称性都有可能降低

必须用z矩阵优化（opt=Z-matrix），但是可能会遇到180度键角的问题

谢谢老大！希望按你说的方法能够解决问题
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至尊木虫
5楼2014-04-09 20:20:05
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枪下游魂

木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by zwnjust at 2014-04-09 20:07:17
谢谢你的耐心解答，我是一个初学者，如何强制最高点群为C3V呢？对于一些未知对称性的分子怎么办呢？...

去看高斯手册symm关键词
未知对称性是什么意思？没优化之前的么？那你优化好自己判断一下喽
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6楼2014-04-10 07:40:50
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