| 查看: 1450 | 回复: 9 | ||
[求助]
挑菌测序，整成这样婶儿的结果，也是跪 已有1人参与
|
|
用植物材料提取的RNA、逆转录后作为模板PCR，之后连T载体挑菌，目标条带是1000bp,菌液PCR后只有一个接上目标条带，其他有数个连进了600bp的，想知道是什么，就一起送生工测序了。 测序结果：1000多的是目标片段，600多的中间缺400bp，其他部位和目标条带一毛一样。DNAMAN Alignment得到的。   我的想法：不可能是内含子吧，我是RNA逆转录的，引物也是按照转录组拼接得到的序列设计的。 可能1.600多的是植物自身的，是另一个基因？ 可能2.产物断裂后，自连缺失了400bp,再接入T载体？ 各位怎么想？求教！！！ |
回复此楼» 猜你喜欢
留学--博士招生
已经有16人回复
-
化学工程，本211，求调剂，ab区不限
已经有4人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有161人回复
-
湖北师范大学招调剂啦
已经有7人回复
-
邵阳学院食品与化学工程学院硕士调剂
已经有0人回复
-
天津商业大学 生物与医药课题组招生
已经有0人回复
-
生物化工学硕招收调剂
已经有0人回复
-
广东石油化工学院2026年硕士研究生需要多名生物，制药工程，食品专业的调剂生
已经有0人回复
-
317分 一志愿江南大学 化学工程学硕 求调剂
已经有6人回复
-
化工申博
已经有1人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-01-14 23:01:14
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-01-14 23:01:14
|
What is the size of your amplification if the template uses the genomic DNA? According the results your described above, I doubt that the approximate 1000 bp fragment came from genomic DNA contaminant. Therefore, the 600 bp fragment would be the target DNA. |
2楼2016-01-11 19:39:35
3楼2016-01-11 20:59:54
4楼2016-01-11 21:08:55
5楼2016-01-11 22:49:32
6楼2016-01-14 20:58:58
llsllslls92
金虫 (小有名气)
- 应助: 11 (小学生)
- 金币: 1012.4
- 红花: 2
- 帖子: 77
- 在线: 68.7小时
- 虫号: 3356558
- 注册: 2014-08-07
- 性别: GG
- 专业: 微生物生理与生物化学
【答案】应助回帖
|
我觉得有两种可能 一是 设计引物时没有跨内含子设计，只要提RNA质量不好混有基因DNA就会把内含子给扩增出来 二是 基因的变位剪接导致的 有可能少的少的部分就是该基因的其中一个外显子序列 （最近做实验发现了这样的突变体了的 ） 个人观点而已～ 发自小木虫Android客户端 |
7楼2016-01-15 02:05:58
8楼2016-05-13 22:27:23
9楼2016-05-13 23:25:55
10楼2016-05-16 10:47:10
