24小时热门版块排行榜    

查看: 5388  |  回复: 39
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

397608492

新虫 (小有名气)

[求助] 毕赤酵母高拷贝筛选 已有2人参与

如题,本人新手,做蛋白分子改造的,之前将目的基因构建在pPICZaA和pGAPZaA上并利用博莱霉素筛选高拷贝,浓度达到1ug/ml,菌落PCR后挑取阳性菌落摇瓶表达,结果表达量极低。现在改变策略构建到pPIC9K上用G418筛选高拷贝,想问问各位达人G418能不能和氨苄同时使用,因为之前做的时候涂布His+转化子的G418平板老是不长酵母而长杂菌。另外还想问问是不是带有his tag的蛋白酵母的表达量会降低?因为我想要拿比较高表达量的菌株对该蛋白进行表征。有文献建议His+转化子不经过G418筛选高拷贝而直接以深孔板培养筛选高表达量菌株,各位觉得哪种方法更靠谱呢?在同一个梯度的平板上,各菌株的表达量差异会否很大?

发自小木虫Android客户端
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

397608492

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by mlbiosci at 2015-10-05 00:11:58
梯度加压,增加zeocin浓度,筛选到2000的浓度,调取克隆进行表达小试进一步筛选。根据经验,高浓度板子上长出来的克隆表达量不见得高,曾有过不表达的情况。

是一个板挑几个么,所谓表达小试是摇瓶还是什么?还是不同梯度的各挑几个

发自小木虫Android客户端
3楼2015-10-05 00:25:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

397608492

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by mlbiosci at 2015-10-05 12:29:11
最高浓度板子上挑几个摇瓶表达检测

谢谢你,还想问问摇瓶是挡板瓶还是普通的呢?因为实验室摇床无法到300rpm,最多到200rpm,害怕溶氧不行。我想做小一点的,50ml一个。选几个比较合适啊?因为我最高浓度的平板上也有接近50个。总不能都挑吧。。。

发自小木虫Android客户端
5楼2015-10-05 12:36:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

397608492

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by duoyidian at 2015-10-05 18:53:14
可以这样筛选:
先用His缺陷型筛选,即MGY或者MD培养级进行初筛;等大概一天左右的时间,班上出现略微明显的菌落之后,将菌落用2-3ml无菌水洗下来,富集菌体,测定菌浓OD600,0.04OD,0.12OD,0.2OD菌体(取大概50 ...

谢谢你的回复,我看说明书说是富集菌体以无菌水稀释至OD600=0.002(10^5个细胞/ml),取200ul涂布YPD G418平板,想问问平板里除了G418能不能加入氨苄?另外你的方法为什么涂布OD这么高啊?我的MD平板上长了接近上千个菌落,复筛是选取最高抗性浓度的平板上长的单菌落进行PCR验证和摇瓶复筛吗?

发自小木虫Android客户端
7楼2015-10-06 00:26:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

397608492

新虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by duoyidian at 2015-10-06 12:11:55
1)你要筛选高拷贝菌株,由于高拷贝的概率问题,菌体量的增加是为了增加筛出高拷贝的概率,同时如果你的MD平板长出太多的菌体的话,也是正常的,因此才需要用抗生素进行第二次筛选。
2)添加氨苄为什么?没见过这么 ...

我只是单纯想要获得最高产的菌株,仅此而已。

发自小木虫Android客户端
9楼2015-10-06 13:36:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

397608492

新虫 (小有名气)

引用回帖:
10楼: Originally posted by duoyidian at 2015-10-07 10:47:53
那就直接筛啊,然后做个摇瓶就好了...

是从最高抗性浓度的平板上选几个做摇瓶么?

发自小木虫Android客户端
11楼2015-10-07 12:36:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

397608492

新虫 (小有名气)

引用回帖:
12楼: Originally posted by duoyidian at 2015-10-07 12:55:08
对于不同的蛋白拷贝数与目的蛋白产量的关系是不确定的,有的蛋白在较低拷贝数下的蛋白产量反而较高,这些都是说不清的额,具体情况具体分析,看自己的目的与课题要求而定...

那我能不能把平板上所有的转化子都在96孔板里培养进行筛选?

发自小木虫Android客户端
13楼2015-10-07 17:40:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

397608492

新虫 (小有名气)

引用回帖:
14楼: Originally posted by duoyidian at 2015-10-07 18:14:07
检测方便就行啊,这都是一些基础的重复操作,你可以多尝试一些,只要你有时间...

但之前做了一次,不知道是不是因为深孔板溶氧不行,导致不产酶。。。

发自小木虫Android客户端
15楼2015-10-07 22:32:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

397608492

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by mlbiosci at 2015-10-05 00:11:58
梯度加压,增加zeocin浓度,筛选到2000的浓度,调取克隆进行表达小试进一步筛选。根据经验,高浓度板子上长出来的克隆表达量不见得高,曾有过不表达的情况。

是每一个梯度下挑几个做摇瓶么?

发自小木虫Android客户端
16楼2015-10-08 07:27:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

397608492

新虫 (小有名气)

引用回帖:
17楼: Originally posted by mlbiosci at 2015-10-08 07:55:11
我们的做法是最高浓度板子上挑克隆。另外,96孔板固然方便,但是对于酵母菌,个人认为不太好用,溶氧少,空间小,建议五十毫升锥形瓶,10~15毫升装液量试试
...

做多少个呢?

发自小木虫Android客户端
18楼2015-10-08 09:19:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 397608492 的主题更新
信息提示
请填处理意见