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雨儿天0320

铜虫 (正式写手)

[求助] 碱基序列测序回来后,一般用什么软件进行分析及分子步骤或求助相关资料、 已有2人参与

大家好“
       我做了一段时间的基因组DNA提取。PCR、纯化和连接转化工作。并送去测序,已反馈得到结果,请问怎么进行分析,或是请各位体佛南方一下资料!
非常感谢!
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雨儿天0320

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 品茗听雨0530 at 2015-09-28 21:47:44
首先在得到的序列中找到引物,然后将两端载体序列去掉,在NCBI中将序列进行Blast。

谢谢
5楼2015-09-29 13:06:36
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查看全部 7 个回答

品茗听雨0530

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-09-28 22:52:59
雨儿天0320: 金币+2 2015-09-29 13:05:38
首先在得到的序列中找到引物,然后将两端载体序列去掉,在NCBI中将序列进行Blast。
2楼2015-09-28 21:47:44
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glssg

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
雨儿天0320: 金币+2 2015-09-29 13:06:21
我当时做克隆的目的片段是用于后续实验,在ncbi里并找不到,目的基因设计引物的时候就已经得到了,放在fasta文件里。所以我拿来测序结果是在word里寻找上下引物,序列的反向互补用primer5,找到引物后删除引物之外的序列,将序列以fasta格式放入上面提到的fsata文件里,再用mega6比对。这是我自己琢磨的,可能很麻烦,当个参考吧。

发自小木虫Android客户端
不安于现在而又安于现在
3楼2015-09-29 07:52:25
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雨儿天0320

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by glssg at 2015-09-29 07:52:25
我当时做克隆的目的片段是用于后续实验,在ncbi里并找不到,目的基因设计引物的时候就已经得到了,放在fasta文件里。所以我拿来测序结果是在word里寻找上下引物,序列的反向互补用primer5,找到引物后删除引物之外的 ...

谢谢!
4楼2015-09-29 13:06:30
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