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雨儿天0320

铜虫 (正式写手)

[求助] 碱基序列测序回来后，一般用什么软件进行分析及分子步骤或求助相关资料、 已有2人参与

大家好“
       我做了一段时间的基因组DNA提取。PCR、纯化和连接转化工作。并送去测序，已反馈得到结果，请问怎么进行分析，或是请各位体佛南方一下资料！
非常感谢！
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1楼 2015-09-28 15:57:14
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品茗听雨0530

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-09-28 22:52:59
雨儿天0320: 金币+2 2015-09-29 13:05:38
首先在得到的序列中找到引物，然后将两端载体序列去掉，在NCBI中将序列进行Blast。
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2楼2015-09-28 21:47:44
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glssg

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
雨儿天0320: 金币+2 2015-09-29 13:06:21
我当时做克隆的目的片段是用于后续实验，在ncbi里并找不到，目的基因设计引物的时候就已经得到了，放在fasta文件里。所以我拿来测序结果是在word里寻找上下引物，序列的反向互补用primer5，找到引物后删除引物之外的序列，将序列以fasta格式放入上面提到的fsata文件里，再用mega6比对。这是我自己琢磨的，可能很麻烦，当个参考吧。

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不安于现在而又安于现在
3楼2015-09-29 07:52:25
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雨儿天0320

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by glssg at 2015-09-29 07:52:25
我当时做克隆的目的片段是用于后续实验，在ncbi里并找不到，目的基因设计引物的时候就已经得到了，放在fasta文件里。所以我拿来测序结果是在word里寻找上下引物，序列的反向互补用primer5，找到引物后删除引物之外的 ...

谢谢！
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4楼2015-09-29 13:06:30
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雨儿天0320

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 品茗听雨0530 at 2015-09-28 21:47:44
首先在得到的序列中找到引物，然后将两端载体序列去掉，在NCBI中将序列进行Blast。

谢谢
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5楼2015-09-29 13:06:36
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leilaxx

金虫 (小有名气)
怎么去除载体序列

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6楼2015-10-19 13:45:16
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tolobio

新虫 (小有名气)
内容已删除
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7楼2015-10-19 14:14:03
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