24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1666  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

雨儿天0320

铜虫 (正式写手)

[求助] 碱基序列测序回来后,一般用什么软件进行分析及分子步骤或求助相关资料、 已有2人参与

大家好“
       我做了一段时间的基因组DNA提取。PCR、纯化和连接转化工作。并送去测序,已反馈得到结果,请问怎么进行分析,或是请各位体佛南方一下资料!
非常感谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

glssg

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
雨儿天0320: 金币+2 2015-09-29 13:06:21
我当时做克隆的目的片段是用于后续实验,在ncbi里并找不到,目的基因设计引物的时候就已经得到了,放在fasta文件里。所以我拿来测序结果是在word里寻找上下引物,序列的反向互补用primer5,找到引物后删除引物之外的序列,将序列以fasta格式放入上面提到的fsata文件里,再用mega6比对。这是我自己琢磨的,可能很麻烦,当个参考吧。

发自小木虫Android客户端
不安于现在而又安于现在
3楼2015-09-29 07:52:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

品茗听雨0530

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-09-28 22:52:59
雨儿天0320: 金币+2 2015-09-29 13:05:38
首先在得到的序列中找到引物,然后将两端载体序列去掉,在NCBI中将序列进行Blast。
2楼2015-09-28 21:47:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雨儿天0320

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by glssg at 2015-09-29 07:52:25
我当时做克隆的目的片段是用于后续实验,在ncbi里并找不到,目的基因设计引物的时候就已经得到了,放在fasta文件里。所以我拿来测序结果是在word里寻找上下引物,序列的反向互补用primer5,找到引物后删除引物之外的 ...

谢谢!
4楼2015-09-29 13:06:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雨儿天0320

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 品茗听雨0530 at 2015-09-28 21:47:44
首先在得到的序列中找到引物,然后将两端载体序列去掉,在NCBI中将序列进行Blast。

谢谢
5楼2015-09-29 13:06:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料相关专业344求调剂双非工科学校或课题组 +24 hualkop 2026-04-12 26/1300 2026-04-18 23:33 by 路病情
[考研] 一志愿沪9,326求生物学调剂 +12 刘墨墨 2026-04-13 12/600 2026-04-18 23:31 by 路病情
[考研] 260求调剂 +4 Zyt1314520.. 2026-04-17 5/250 2026-04-18 08:28 by babysonlkd
[考研] 急需调剂 +9 绝不放弃22 2026-04-15 10/500 2026-04-18 08:09 by chixmc
[考研] 化工学硕294分,求导师收留 +33 yzyzx 2026-04-12 37/1850 2026-04-17 23:00 by wunaiy88
[考研] 求调剂 +9 小聂爱学习 2026-04-16 11/550 2026-04-17 22:34 by chixmc
[考研] 335求调剂 +20 想上岸呀!! 2026-04-12 23/1150 2026-04-17 10:50 by cuisz
[考研] 恳请有学校收留 +8 柯淮然 2026-04-12 8/400 2026-04-17 09:34 by 猪会飞
[考研] 一志愿沪9,生物学326求调剂 +9 刘墨墨 2026-04-15 9/450 2026-04-16 17:14 by 崔崔崔cccc
[考研] 26药学专硕105500求调剂 +6 喽哈加油 2026-04-13 7/350 2026-04-16 14:31 by zhouxiaoyu
[考研] 279学硕食品专业求调剂院校 20+7 孤独的狼爱吃羊 2026-04-12 29/1450 2026-04-16 09:00 by screening
[考研] 一志愿A区211,22408 321求调剂 +6 随心所欲☆ 2026-04-15 7/350 2026-04-15 21:45 by lbsjt
[考研] 药学求调剂 +11 RussHu 2026-04-12 13/650 2026-04-15 19:07 by zhuwenxu
[考研] 求调剂 +12 何气正 2026-04-13 13/650 2026-04-14 14:47 by zs92450
[考研] 考研调剂 +13 长弓傲 2026-04-13 14/700 2026-04-14 14:44 by zs92450
[考研] 食品与营养(0955)271求调剂 +15 升格阿达 2026-04-12 16/800 2026-04-14 13:18 by 浮若_安生
[考研] 297工科,求调剂? +13 河南农业大学-能 2026-04-12 13/650 2026-04-13 14:12 by dingyanbo1
[考研] 一志愿085802 323分求调剂 +13 drizzle_9 2026-04-12 14/700 2026-04-13 10:26 by Faiz5552
[考研] +10 李多米lee. 2026-04-12 11/550 2026-04-12 22:58 by yuyin1233
[考研] 346分,工科0854求调剂,专硕 +6 moser233 2026-04-12 7/350 2026-04-12 22:11 by fqwang
信息提示
请填处理意见