应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 碱基序列测序回来后，一般用什么软件进行分析及分子步骤或求助相关资料、
71/1返回列表
查看: 1795  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

雨儿天0320

铜虫 (正式写手)

[求助] 碱基序列测序回来后，一般用什么软件进行分析及分子步骤或求助相关资料、 已有2人参与

大家好“
       我做了一段时间的基因组DNA提取。PCR、纯化和连接转化工作。并送去测序，已反馈得到结果，请问怎么进行分析，或是请各位体佛南方一下资料！
非常感谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2015-09-28 15:57:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

品茗听雨0530

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-09-28 22:52:59
雨儿天0320: 金币+2 2015-09-29 13:05:38
首先在得到的序列中找到引物，然后将两端载体序列去掉，在NCBI中将序列进行Blast。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2015-09-28 21:47:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

glssg

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
雨儿天0320: 金币+2 2015-09-29 13:06:21
我当时做克隆的目的片段是用于后续实验，在ncbi里并找不到，目的基因设计引物的时候就已经得到了，放在fasta文件里。所以我拿来测序结果是在word里寻找上下引物，序列的反向互补用primer5，找到引物后删除引物之外的序列，将序列以fasta格式放入上面提到的fsata文件里，再用mega6比对。这是我自己琢磨的，可能很麻烦，当个参考吧。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
不安于现在而又安于现在
3楼2015-09-29 07:52:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雨儿天0320

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by glssg at 2015-09-29 07:52:25
我当时做克隆的目的片段是用于后续实验，在ncbi里并找不到，目的基因设计引物的时候就已经得到了，放在fasta文件里。所以我拿来测序结果是在word里寻找上下引物，序列的反向互补用primer5，找到引物后删除引物之外的 ...

谢谢！
回复此楼
4楼2015-09-29 13:06:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雨儿天0320

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 品茗听雨0530 at 2015-09-28 21:47:44
首先在得到的序列中找到引物，然后将两端载体序列去掉，在NCBI中将序列进行Blast。

谢谢
回复此楼
5楼2015-09-29 13:06:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

leilaxx

金虫 (小有名气)
怎么去除载体序列

发自小木虫Android客户端
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2015-10-19 13:45:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tolobio

新虫 (小有名气)
内容已删除
回复此楼
7楼2015-10-19 14:14:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 雨儿天0320 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 kvewwGtKktqB 2026-11-04 14/700 2026-11-05 22:46 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 15/750 2026-11-05 22:44 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 13/650 2026-11-05 22:44 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 11/550 2026-11-05 22:35 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +7 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 20/1000 2026-11-05 22:33 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 PYZmcHr5kSaq 2026-11-05 5/250 2026-11-05 21:27 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 3/150 2026-11-05 21:05 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 3/150 2026-11-05 21:05 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 8/400 2026-11-05 20:54 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 7/350 2026-11-05 20:43 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 8/400 2026-11-05 20:43 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 8/400 2026-11-05 20:43 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 9/450 2026-11-05 20:34 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 12/600 2026-11-05 20:21 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 9/450 2026-11-05 20:10 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 6/300 2026-11-05 18:00 by My20PsvIExYO
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 13/650 2026-11-05 17:15 by My20PsvIExYO
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-05 15:46 by My20PsvIExYO
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 9/450 2026-11-05 15:13 by My20PsvIExYO
[基金申请] 各位基础老师们，看完中央《从严治党》的决定后，对学术界更加有信心了吧 +5 iaeyuan 2026-11-01 5/250 2026-11-04 14:43 by jinchengzi
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭