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引物设计的问题
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我从NCBI上找到两段基因片段,用blast进行对比,有好几个变异位点,我想选其中一个来设计引物,那这几个当中我选哪个呢,这个有没有什么方法来鉴定,选哪个是最好的,还是都一样,随便选一个?新手,不是很懂这方面,希望有大牛指导!谢谢啦!
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1楼
2015-07-23 09:47:48
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董小露(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流
2015-07-24 10:28:27
两个序列应该不可能是完全一致的 我觉得你可以选一个 设计就可以了 设计引物也不是全序列都需要 也就是需要前后的两端序列
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2015-07-23 13:21:37
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Originally posted by
人车
at 2015-07-23 13:21:37
两个序列应该不可能是完全一致的 我觉得你可以选一个 设计就可以了 设计引物也不是全序列都需要 也就是需要前后的两端序列
不是设计整个序列的,是想选一个变异位点设计一段特异性的,随便找哪个变异位点都可以是吗
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3楼
2015-07-23 13:26:04
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Originally posted by
董小露
at 2015-07-23 13:26:04
不是设计整个序列的,是想选一个变异位点设计一段特异性的,随便找哪个变异位点都可以是吗...
有点没看明白 那就是你不是要基因的全长是吗?
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4楼
2015-07-23 16:53:51
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是想研究变异位点么?在变异位点上游和下游设计引物就好了吧?按照引物设计原则设计。
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5楼
2015-07-24 11:23:32
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【答案】应助回帖
查一下文献,看看变异点有木有影响,那个点有影响。我做酶的基因克隆,按照文献报道,那酶保守区的好几个氨基酸可变异。。。
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6楼
2015-07-24 11:26:50
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我也是新手,找到的就直接都合成,看结果如何,不过还没做出想要的结果
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7楼
2015-07-28 15:19:39
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Originally posted by
Kellyyoung
at 2015-07-28 15:19:39
我也是新手,找到的就直接都合成,看结果如何,不过还没做出想要的结果
想问一下你做的有结果了吗
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8楼
2015-09-08 11:41:34
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Originally posted by
yufeiwaner
at 2015-07-24 11:26:50
查一下文献,看看变异点有木有影响,那个点有影响。我做酶的基因克隆,按照文献报道,那酶保守区的好几个氨基酸可变异。。。
确实有很多的变异位点,要选其中一个吧,我就不知道该怎么选了
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9楼
2015-09-08 11:43:40
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