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1楼2015-07-09 11:32:51

biolinker

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【答案】应助回帖

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张宝儿: 金币+3, ★★★很有帮助 2015-07-09 20:59:12

常规的方法有PCR-DGGE平台、克隆文库、RFLP、454 及 illumina miseq 高通量测序平台等，现在比较流行的是高通量测平台。

2楼2015-07-09 14:53:33

张宝儿

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2楼: Originally posted by biolinker at 2015-07-09 14:53:33
常规的方法有PCR-DGGE平台、克隆文库、RFLP、454 及 illumina miseq 高通量测序平台等，现在比较流行的是高通量测平台。

只用高通量测序就可以表示群落结构和种类了是么？

3楼2015-07-09 20:59:49

shanliwademen

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【答案】应助回帖

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张宝儿: 金币+2, ★有帮助 2015-07-10 15:17:41

兄弟，你打算做免培养还是培养？你先想好，但不要做DGGE,那个东西真心不行，要是做免培养的优势菌群可以考虑，但你要是不缺实验经费就直接不要考虑

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4楼2015-07-10 02:17:48

张宝儿

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4楼: Originally posted by shanliwademen at 2015-07-10 02:17:48
兄弟，你打算做免培养还是培养？你先想好，但不要做DGGE,那个东西真心不行，要是做免培养的优势菌群可以考虑，但你要是不缺实验经费就直接不要考虑

免培养

5楼2015-07-10 15:17:31

笑笑咖啡-125

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土壤中的微生物群落类型，种间数量，如何检测计数啊？，

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学习优秀的别人，做最好的自己。

6楼2015-07-12 00:28:12

ruociwang

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3楼: Originally posted by 张宝儿 at 2015-07-09 20:59:49
只用高通量测序就可以表示群落结构和种类了是么？...

是的，具体来说是16S扩增子高通量测序，一般用的是miseq，454算是退出市场被淘汰了。DGGE、RFLP强烈不建议了，不仅仅是麻烦与恶心的问题了。克隆文库的话如果不是很特殊的情况，也是不怎么用的。

不论付出多少努力，一定要把上海生命科学院的大门给撞开了！

7楼2015-07-13 09:19:57

崔士元

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现在主流平台是Miseq，我们是最早做微生物多样性分析的，可以联系我252950445

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男人，就要对自己狠一点！

8楼2016-01-13 11:39:11

崔士元

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3楼: Originally posted by 张宝儿 at 2015-07-09 20:59:49
只用高通量测序就可以表示群落结构和种类了是么？...

物种种类，相对丰度等

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男人，就要对自己狠一点！

9楼2016-01-13 11:39:44