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张宝儿

新虫 (小有名气)

[求助] 微生物群落结构和多样性的测定，常用用什么方法？哪些方法比较先进？？？ 已有2人参与

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微生物群落结构和多样性的测定，常用用什么方法？哪些方法比较先进？？？
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1楼 2015-07-09 11:32:51
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biolinker

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
张宝儿: 金币+3, ★★★很有帮助 2015-07-09 20:59:12
常规的方法有PCR-DGGE平台、克隆文库、RFLP、454 及 illumina miseq 高通量测序平台等，现在比较流行的是高通量测平台。
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2楼2015-07-09 14:53:33
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张宝儿

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by biolinker at 2015-07-09 14:53:33
常规的方法有PCR-DGGE平台、克隆文库、RFLP、454 及 illumina miseq 高通量测序平台等，现在比较流行的是高通量测平台。

只用高通量测序 就可以表示群落结构和种类了 是么？
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3楼2015-07-09 20:59:49
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shanliwademen

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
张宝儿: 金币+2, ★有帮助 2015-07-10 15:17:41
兄弟，你打算做免培养还是培养？你先想好，但不要做DGGE,那个东西真心不行，要是做免培养的优势菌群可以考虑，但你要是不缺实验经费就直接不要考虑

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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4楼2015-07-10 02:17:48
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张宝儿

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by shanliwademen at 2015-07-10 02:17:48
兄弟，你打算做免培养还是培养？你先想好，但不要做DGGE,那个东西真心不行，要是做免培养的优势菌群可以考虑，但你要是不缺实验经费就直接不要考虑

免培养
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5楼2015-07-10 15:17:31
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笑笑咖啡-125

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by shanliwademen at 2015-07-10 02:17:48
兄弟，你打算做免培养还是培养？你先想好，但不要做DGGE,那个东西真心不行，要是做免培养的优势菌群可以考虑，但你要是不缺实验经费就直接不要考虑

土壤中的微生物群落类型，种间数量，如何检测计数啊？，

[ 发自小木虫客户端 ]
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学习优秀的别人，做最好的自己。
6楼2015-07-12 00:28:12
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ruociwang

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 张宝儿 at 2015-07-09 20:59:49
只用高通量测序 就可以表示群落结构和种类了 是么？...

是的，具体来说是16S扩增子高通量测序，一般用的是miseq，454算是退出市场被淘汰了。DGGE、RFLP强烈不建议了，不仅仅是麻烦与恶心的问题了。克隆文库的话如果不是很特殊的情况，也是不怎么用的。
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不论付出多少努力，一定要把上海生命科学院的大门给撞开了！
7楼2015-07-13 09:19:57
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崔士元

金虫 (正式写手)
现在主流平台是Miseq，我们是最早做微生物多样性分析的，可以联系我252950445

发自小木虫IOS客户端
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男人，就要对自己狠一点！
8楼2016-01-13 11:39:11
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崔士元

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 张宝儿 at 2015-07-09 20:59:49
只用高通量测序 就可以表示群落结构和种类了 是么？...

物种种类，相对丰度等

发自小木虫IOS客户端
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男人，就要对自己狠一点！
9楼2016-01-13 11:39:44
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