[求助] 要用Gaussian 09计算氢键间的作用力，已有1人参与

刚需要用到Gaussian 09计算氢键间的作用力，不知道怎么操作，哪个大神能告诉迅速入手的资料，或方法，万谢！

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我哩个去啊！

1楼 2015-06-23 10:46:23

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拉奇朱丹

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应助: 3 (幼儿园)
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【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
xiaohai3135: 金币+1, ★有帮助, 谢谢你！ 2015-06-26 15:38:51

先优化构型，然后用GAUSSIAN计算波函数，将波函数导入AIM2000软件里进行AIM分析，通过推荐你看兰州大学的一篇博士论文，分子间弱相互作用体系的理论研究_氢键_范德华相互作用和卤键，里面有介绍。

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3楼2015-06-26 09:23:58

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zhou2009

版主 (著名写手)

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【答案】应助回帖

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gmy1990: 金币+3, 感谢应助 2015-06-24 17:09:11
xiaohai3135: 金币+30, ★★★很有帮助, 谢谢，我先操作下！感谢！ 2015-06-25 15:41:29

首先，要根据氢键体系的大小选择计算方法，如RHF、B3LYP方法不适合算氢键。体系如果太大方法太精，又可能算不动。关于方法见最近的讨论：如何计算分子间的弱相互作用以及分析氢键：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=9082533&fpage=1
其次，分别优化计算形成氢键的A和B，然后将A和B按预想的氢键结合方式摆在一起，对氢键体系进行优化。
最后，将计算得到的分子A的能量E(A)、分子B的能量E(B)以及氢键分子体系的能量E(AB) ，计算E(AB)-E(A)-E(B)的绝对值，即是分子间的氢键作用能。一般还要做BSSE修正。

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2楼2015-06-23 16:55:24

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xiaohai3135

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