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po390

金虫 (小有名气)

[交流] 静电作用的截断半径

各位大神,目前我想使用NAMD重复一个grmoacs软件的模拟,但在grmaocs软件中静电及范德华作用的截断半径可以分别设置,但在NAMD中只有一个cutoff参数进行设置,且静电及范德华作用的截断半径只能设为一样。有什么办法可以在NAMD中分别设置静电及范德华作用的截断半径?
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po390

金虫 (小有名气)

引用回帖:
15楼: Originally posted by sciencejoy at 2015-06-09 15:10:23
静电相互作用是长程相互作用,干嘛截断?截断就不对了

这个我不太懂,我看的文献中都提到了对静电作用的截断半径,NAMD手册中对cutoff的介绍是 local interaction distance common to both electrostatic and van der Waals calculations,但我想做的是想grmaocs一样electrostatic与van der Waals的cutoff分别设置,请问这可以实现吗
16楼2015-06-09 15:57:59
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普通回帖

po390(金币+2): 谢谢参与
2楼2015-06-08 22:28:35
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po390(金币+2): 谢谢参与
3楼2015-06-08 22:29:18
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po390(金币+2): 谢谢参与
4楼2015-06-08 22:29:27
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木~木~呆

木虫 (职业作家)


po390(金币+2): 谢谢参与
^ω^
5楼2015-06-08 22:29:53
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gorgan

木虫之王 (文学泰斗)


po390(金币+2): 谢谢参与
祝福

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6楼2015-06-08 22:30:02
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木~木~呆

木虫 (职业作家)


po390(金币+2): 谢谢参与
^ω^
7楼2015-06-08 22:30:05
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gorgan

木虫之王 (文学泰斗)

无意苦争春


po390(金币+2): 谢谢参与
祝好啊

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
无我相,无人相,无众生相,无寿者相
8楼2015-06-08 22:30:13
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po390(金币+2): 谢谢参与
1

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
9楼2015-06-08 22:30:18
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po390(金币+2): 谢谢参与
1

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
10楼2015-06-08 22:30:26
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