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po390

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[交流] 静电作用的截断半径

各位大神，目前我想使用NAMD重复一个grmoacs软件的模拟，但在grmaocs软件中静电及范德华作用的截断半径可以分别设置，但在NAMD中只有一个cutoff参数进行设置，且静电及范德华作用的截断半径只能设为一样。有什么办法可以在NAMD中分别设置静电及范德华作用的截断半径？

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1楼 2015-06-08 22:18:43

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po390

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引用回帖:

15楼: Originally posted by sciencejoy at 2015-06-09 15:10:23
静电相互作用是长程相互作用，干嘛截断？截断就不对了

这个我不太懂，我看的文献中都提到了对静电作用的截断半径，NAMD手册中对cutoff的介绍是 local interaction distance common to both electrostatic and van der Waals calculations，但我想做的是想grmaocs一样electrostatic与van der Waals的cutoff分别设置，请问这可以实现吗