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小小佐罗2木虫 (正式写手)
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微生物454测序相关问题 已有1人参与
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各位大神，小弟前面做了微生物多样性的454测序，投稿了一篇文章，编辑反馈回来的意见有一句话看了很久不知道什么意思？请做过这方面的各位帮忙解释下， 原句为This section is insufficient to assess beta diversity. I suggest the authors use complimentary measures, i.e. OTU vs. Phylogenetic and Presence/Absence vs. Abundance measures (Jacaard, Bray-Curtis, unweighted and weighted UniFrac), to provide a more comprehensive assessment. weigthed and unweighted unifrac 已经做了， 关键是 OTU vs. Phylogenetic 这个应该是什么图 表示什么意思？ 求解答 万分感谢 |
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hkqgeoffrey
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【答案】应助回帖
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小小佐罗2: 金币+10, ★有帮助, 想了很久 想明白了 编辑是想让我从otu的水平上 和物种分类水平上都做PCoA图 看看趋势一致不 ， 还有个问题请教这句话编辑还加了一句Statistical significance could be assessed using "Adonis" in the R package "vegan"，想了半天也不甚明白 请指教 2015-06-10 08:56:15
小小佐罗2: 金币+10, ★有帮助, 想了很久 想明白了 编辑是想让我从otu的水平上 和物种分类水平上都做PCoA图 看看趋势一致不 ， 还有个问题请教这句话编辑还加了一句Statistical significance could be assessed using "Adonis" in the R package "vegan"，想了半天也不甚明白 请指教 2015-06-10 08:56:15
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从这段回复看他是建议你采用两种结论能进行互补的方法：比如OTU法和进化树法 或者后面的两种方法 [ 发自手机版 http://muchong.com/3g ] |
4楼2015-06-08 08:45:40
5楼2015-06-24 14:49:04
