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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 微生物454测序相关问题
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小小佐罗2

木虫 (正式写手)

[求助] 微生物454测序相关问题已有1人参与

各位大神，小弟前面做了微生物多样性的454测序，投稿了一篇文章，编辑反馈回来的意见有一句话看了很久不知道什么意思？请做过这方面的各位帮忙解释下，
原句为This section is insufficient to assess beta diversity. I suggest the authors use complimentary measures, i.e. OTU vs. Phylogenetic and Presence/Absence vs. Abundance measures (Jacaard, Bray-Curtis, unweighted and weighted UniFrac), to provide a more comprehensive assessment.
weigthed and unweighted unifrac 已经做了， 关键是 OTU vs. Phylogenetic  这个应该是什么图 表示什么意思？ 求解答 万分感谢
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1楼2015-06-07 15:09:22
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hkqgeoffrey

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
其中之一应该是构建进化树吧？
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兴趣是第一导师，我爱它，因此我毫无疲倦的探索
2楼2015-06-08 00:46:31
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小小佐罗2

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hkqgeoffrey at 2015-06-08 00:46:31
其中之一应该是构建进化树吧？

不是的
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3楼2015-06-08 08:10:44
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hkqgeoffrey

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小小佐罗2: 金币+10, ★有帮助, 想了很久 想明白了 编辑是想让我从otu的水平上 和物种分类水平上都做PCoA图 看看趋势一致不 ， 还有个问题请教这句话编辑还加了一句Statistical significance could be assessed using "Adonis" in the R package "vegan"，想了半天也不甚明白 请指教 2015-06-10 08:56:15
引用回帖:
3楼: Originally posted by 小小佐罗2 at 2015-06-08 08:10:44
不是的...

从这段回复看他是建议你采用两种结论能进行互补的方法：比如OTU法和进化树法   或者后面的两种方法

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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兴趣是第一导师，我爱它，因此我毫无疲倦的探索
4楼2015-06-08 08:45:40
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872940890

铁虫 (小有名气)
可能是用otu来做系统发育树吧？
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我知道我得继续努力！加油！
5楼2015-06-24 14:49:04
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