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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 求解1个晶体结构
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e_agle

至尊木虫 (正式写手)

[求助] 求解1个晶体结构 已有2人参与

得到一个配合物晶体结构，这方面几乎一无所知，也找人帮着看了一下，说有一个A类错误，不知道如何解决，请大家帮忙一下。
看看是否可以达到发表的标准。晶体很难得到，重测数据几无可能。
谢谢！
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超分子化学
1楼 2015-06-04 09:25:36
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calebby

捐助贵宾 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
e_agle: 金币+15, ★★★很有帮助, 谢谢帮忙！ 2015-06-08 19:10:18
数据已经解析好，详见附件。之前的数据中有原子定错了，并且数据没解完。

Bond precision:        C-C = 0.0081 A        Wavelength=0.71073
Cell:        a=21.172(8)        b=18.855(7)        c=8.624(3)
alpha=90        beta=90        gamma=90
Temperature:        296 K               
Calculated        Reported
Volume        3443(2)        3443(2)
Space group        P n m a        Pnma
Hall group        -P 2ac 2n        ?
Moiety formula        C36 H28 Cl N5 O7 Zn        ?
Sum formula        C36 H28 Cl N5 O7 Zn        C144 H112 Cl4 N20 O28 Zn4
Mr        743.47        2973.90
Dx,g cm-3        1.434        1.434
Z        4        1
Mu (mm-1)        0.848        0.848
F000        1528.0        1528.0
F000'        1530.34       
h,k,lmax        27,24,11        27,24,11
Nref        4176        4149
Tmin,Tmax        0.850,0.881        0.849,0.883
Tmin'        0.844       
Correction method= # Reported T Limits: Tmin=0.849 Tmax=0.883 AbsCorr = MULTI-SCAN       
Data completeness= 0.994        Theta(max)= 27.750
R(reflections)= 0.0781( 2300)        wR2(reflections)= 0.2374( 4149)
S = 0.995        Npar= 238
The following ALERTS were generated. Each ALERT has the format
       test-name_ALERT_alert-type_alert-level.
Click on the hyperlinks for more details of the test.
Alert level C
PLAT220_ALERT_2_C Large Non-Solvent  O     Ueq(max)/Ueq(min) Range        4.4 Ratio
PLAT241_ALERT_2_C High      Ueq as Compared to Neighbors for .....         O3 Check
PLAT242_ALERT_2_C Low       Ueq as Compared to Neighbors for .....        Zn1 Check
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    • 2015-06-04 10:29:52, 128.12 K
2楼2015-06-04 10:29:56
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匿名

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感谢参与，应助指数 +1
e_agle: 金币+15, ★★★很有帮助, 谢谢帮助！ 2015-06-08 19:10:01
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3楼2015-06-04 11:02:33
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e_agle

至尊木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by lich666 at 2015-06-04 11:02:33
看键长不像硝酸根，看着像醋酸根。
http://pan.baidu.com/s/1mguwWly

A类错误消除了，可是我用的是高氯酸盐，应该怎么解释啊？
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超分子化学
4楼2015-06-04 13:37:55
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匿名

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5楼2015-06-04 14:11:00
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e_agle

至尊木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by lich666 at 2015-06-04 14:11:00
都用什么原料了，说一下。...

晶体结构中显示的配体没有问题，然后用了高氯酸锌。具体操作如下：配体溶于二氯甲烷，高氯酸锌溶于乙腈，混合，然后乙醚缓慢扩散得到晶体结构。
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超分子化学
6楼2015-06-04 14:46:25
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匿名

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7楼2015-06-04 15:00:43
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e_agle

至尊木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by lich666 at 2015-06-04 15:00:43
那个四个原子的配体肯定不是高氯酸，肯定混进去什么了。好好回忆回忆。...

根据您解出的结果，现在的晶体结构中有一个氯，一个醋酸根。我也找别人尝试过，如果都是氯的话，合理，因为高氯酸盐常常会分解得到氯，但是存在很难处理的A类错误。有没有可能都是醋酸根？这样我还能解释是不是用错了金属盐。现在一个氯，一个醋酸根，实在很难理解。
谢谢。
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超分子化学
8楼2015-06-04 15:52:38
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匿名

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9楼2015-06-04 17:36:18
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至尊木虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by lich666 at 2015-06-04 17:36:18
把氯删了周围明显有四个Q峰，只指认成一个氯肯定不对。
四个Q峰要么像楼上说的是个硝酸根，要么就像我说的是醋酸根。所以让你确认下么。是不是溶剂不纯，瓶子不干净，或者什么污染了。
也许是乙腈里残留有醋酸， ...

谢谢！我再确认一下吧。
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超分子化学
10楼2015-06-05 08:54:37
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