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散尽金三百，求高人解一晶体结构！ 已有3人参与
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如题。求高手解析一个晶体结构。 注：结构我已经大致解了一下，配体就是初解的配体。空间中有一个带负电的硝酸根定不下来，溶剂可能是甲醇和水分子（可能会有二氯甲烷）。 要求：check cif 不能有A类和B类错误。 由于小弟金币有限，只能拿出全部的304枚金币。谢谢！ |
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2014-06-12 22:04:58, 497.29 K
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他这个化合物，稀土离子呈现+3价，两个带氧的配体羟基应该是脱质子了，呈-2价，所以缺少一个单位负电荷，就是阴离子作为抗衡阴离子存在，楼主就要精修确定这个。怎么看电荷平不平，你还要看一些金属是否处于特殊点上，比如一个+2价金属离子，如果它的占有率为0.5（处于镜面上或者2重轴上），它对单胞电荷的贡献就是+1；如果占有率是0.25（四重轴或者镜面与二重轴的交点上），贡献就是0.5，阴离子也一样。至于为什么电荷不平不行，就像氯化钠晶体中一定含有等量的氯离子和钠离子一样，一个宏观物质一定是电中性的，那么对于它的最小重复单元来说，也一定是电荷平衡的。有没有氯离子就看楼主的原料了 |
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jfwu017
14楼2014-06-14 18:52:55
beyond-han
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3楼2014-06-13 00:21:33
gkmuse
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【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
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新手练习，仅供参考。 Alert level C PLAT052_ALERT_1_C Info on Absorption Correction Method Not Given . Please Do ! PLAT053_ALERT_1_C Minimum Crystal Dimension Missing (or Error) ... Please Check PLAT054_ALERT_1_C Medium Crystal Dimension Missing (or Error) ... Please Check PLAT055_ALERT_1_C Maximum Crystal Dimension Missing (or Error) ... Please Check PLAT220_ALERT_2_C Large Non-Solvent C Ueq(max)/Ueq(min) Range 3.1 Ratio PLAT230_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff for C17 -- C19 .. 6.8 su PLAT230_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff for C17 -- C31 .. 6.8 su PLAT234_ALERT_4_C Large Hirshfeld Difference C1 -- C32 .. 0.16 Ang. PLAT242_ALERT_2_C Low Ueq as Compared to Neighbors for ..... C17 Check PLAT342_ALERT_3_C Low Bond Precision on C-C Bonds ............... 0.0118 Ang. PLAT731_ALERT_1_C Bond Calc 1.333(13), Rep 1.333(6) ...... 2 su-Rat N10 -C37 1.555 1.555 # 17 And 2 other PLAT731 Alerts More ... Alert level G PLAT040_ALERT_1_G No H-atoms in this Carbon Containing Compound .. Please Check PLAT042_ALERT_1_G Calc. and Reported MoietyFormula Strings Differ Please Check PLAT045_ALERT_1_G Calculated and Reported Z Differ by ............ 8.00 Ratio PLAT128_ALERT_4_G Alternate Setting for Input Space-Group C2/c I2/c Note PLAT606_ALERT_4_G VERY LARGE Solvent Accessible VOID(S) in Structure ! Info PLAT868_ALERT_4_G ALERTS Due to the use of _smtbx_masks Suppressed ! Info 有些C类错误，也可以被处理掉。抱歉，目前，没时间处理。 |
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2014-06-13 00:35:36, 4.36 M
4楼2014-06-13 00:36:09
gkmuse
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【答案】应助回帖
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jfwu017: 金币+30, ★有帮助, 若能将孔道中的硝酸根和溶剂分子定出来，金币全数奉上，谢谢了！ 2014-06-13 15:20:21
jfwu017: 金币+30, ★有帮助, 若能将孔道中的硝酸根和溶剂分子定出来，金币全数奉上，谢谢了！ 2014-06-13 15:20:21
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困了，刚才标错个元素，而且忘记加氢。 没有A，B类错误。  Alert level C PLAT052_ALERT_1_C Info on Absorption Correction Method Not Given . Please Do ! PLAT053_ALERT_1_C Minimum Crystal Dimension Missing (or Error) ... Please Check PLAT054_ALERT_1_C Medium Crystal Dimension Missing (or Error) ... Please Check PLAT055_ALERT_1_C Maximum Crystal Dimension Missing (or Error) ... Please Check PLAT230_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff for O3 -- C7 .. 7.0 su PLAT230_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff for C3 -- C7 .. 5.2 su PLAT342_ALERT_3_C Low Bond Precision on C-C Bonds ............... 0.0085 Ang. PLAT420_ALERT_2_C D-H Without Acceptor N5 - H5A ... Please Check And 3 other PLAT420 Alerts More ... PLAT731_ALERT_1_C Bond Calc 1.330(10), Rep 1.331(4) ...... 3 su-Rat C31 -N47 1.555 1.555 # 36 And 3 other PLAT731 Alerts More ... PLAT732_ALERT_1_C Angle Calc 124.6(7), Rep 124.6(3) ...... 2.33 su-Rat N17 -C31 -N13 1.555 1.555 1.555 # 34 PLAT732_ALERT_1_C Angle Calc 132.4(5), Rep 132.4(2) ...... 2.50 su-Rat C50 -O12 -ER1 1.555 1.555 1.555 # 79 Alert level G PLAT007_ALERT_5_G Number of Unrefined Donor-H Atoms .............. 8 Why ? PLAT042_ALERT_1_G Calc. and Reported MoietyFormula Strings Differ Please Check PLAT045_ALERT_1_G Calculated and Reported Z Differ by ............ 8.00 Ratio PLAT128_ALERT_4_G Alternate Setting for Input Space-Group C2/c I2/c Note PLAT606_ALERT_4_G VERY LARGE Solvent Accessible VOID(S) in Structure ! Info PLAT868_ALERT_4_G ALERTS Due to the use of _smtbx_masks Suppressed ! Info |
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